Habár mindkettő alternatív gyógyszereket képvisel, furcsa, hogy az orvostudomány e két elhagyatott példájának hívői soha nem hasonlították össze egymással, hanem mindig az allopatikus gyógyszerekkel.
Az ajurvédikusokat délkelet-ázsiai ionok esetében a gyakorlatban alkalmazták, míg a homeopátia három évszázadig a gyakorlatban volt. Mindkettő eltérő filozófiát követ a betegségek gyógyításában. Míg egy ajurvédikus gyógyszer kiegészíti a tudományos allopatikus gyógyszereket, addig a homeopátia ellenzi. Az ajurvédikus gyógyszerek hívõi azt állítják, hogy a természetes természet nem árthat az egyikének.
Ayurveda hisz a betegség megelőzésében, míg a homeopátia a betegség gyógyításán alapul. A jóga az ajurvédikus gyógyszerformák egy részét az egész világon gyógymódként használják, és a tudományos közösség széles körben elfogadja..
Az ajurvedában úgy gondolják, hogy az ember bármilyen betegségtől mentes lehet, ha a méreganyagokat kihúzza testéből. Ezenkívül gyógynövényekből és fűszerekből készített orális gyógyszereket, valamint műtéti eljárásokat is alkalmaz a toxinok kiürítéséhez a testből; ezáltal gyógyítja a betegségeket és a különféle betegségeket. A homeopátiában a betegségeket úgy gyógyítják, hogy a betegséghez hasonló tüneteket sokkal hígított formában vezetnek be. Úgy gondolják, hogy ez elősegíti az élet erejét a betegség semlegesítésében, és így a beteg gyógyításában.
A homeopátia filozófiája szerint a betegségekkel nem érintkeznek, hanem bennünk mindig jelen voltak. A homeopátia szakemberei úgy vélik, hogy ezek az életerő-zavarok a betegségek fő okai, és ezeket a betegségek gyógyításához ki kell javítani..
Noha az ajurvéda és a homeopátia is hisz a pozitív elme fontosságában, kezelési formáikban nagymértékben különböznek egymástól. A homeopátia mindig is kritikus volt az alopátiás gyógyszereket illetően, és úgy véli, hogy az alopátiás gyógyszerek által kezelt betegségek soha nem hagyják el teljesen a testet, hanem csak enyhülnek és a betegségek visszatérnek, amikor ezeknek a gyógyszereknek a hatása elmúlik..
Ezeknek a gyógyszereknek az érvényessége mindig vitatott marad, anélkül, hogy az egyik fél a másik felé vonulna.