Különbség az 1D és a 2D gél elektroforézis között

Az kulcs különbség Az 1D és 2D közötti gélelektroforézis a fehérjék gélelektroforézissel történő elválasztására alkalmazott tulajdonságok. Az 1D gél elektroforézis csak a molekulatömeg alapján választja el a fehérjéket, míg a 2D gél elektroforézis elválasztja a fehérjéket izoelektromos pontja és molekulatömege alapján.

A fehérjék elválasztása gélelektroforézissel fontos módszer a fehérjék jellemzésére. A fehérjék változó tulajdonságokkal rendelkeznek; ezért az elválasztás összetettebb, mint az Agarose gélelektroforézissel végzett DNS-elválasztás.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi az 1D gél elektroforézis?
3. Mi a 2D gél elektroforézis?
4. hasonlóságok az 1D és a 2D gél elektroforézis között
5. Side by side összehasonlítás - 1D és 2D gél elektroforézis táblázatos formában
6. Összegzés

Mi az 1D gél elektroforézis??

Az 1D gélelektroforézis, más néven egydimenziós gélelektroforézis, a molekulatömeg alapján történő proteinszétválasztás módszere. A fehérje elválasztása elsősorban poliakrilamid gél elektroforézissel történik. A gélelektroforézis koncepciója alapján a molekulák tulajdonságaik alapján elkülönítik a molekulatömeget és a töltést.

Ezért a fehérjék egyenletes töltése érdekében a nátrium-dodecil-szulfát (SDS) kezelést a gélelektroforézis előtt végezzük. Az SDS denaturálja a fehérjéket és egyenletes negatív töltést biztosít a fehérjére; amikor az elektromos mező alkalmazására kerül sor, a fehérjék molekulatömegük alapján pozitív terminálba vándorolnak. Tehát szétválasztáskor csak egy tulajdonságot vesznek figyelembe. Ez az oka annak, hogy ezt a módszert 1D gélelektroforézisnek nevezzük.

01. ábra: 1D gél elektroforézis

Az 1D gélelektroforézis során a fehérjéket molekulatömegük alapján választják szét. Ebben a tekintetben az alacsony tömegű molekulák gyorsabban vándorolnak a gélben, mint a nagy molekulatömegű fehérjék. Így a nagy tömegű fehérjék a kutak közelében maradnak.

Mi a 2D gél elektroforézis??

A 2D gélelektroforézis vagy a kétdimenziós gélelektroforézis elválasztja a fehérjéket két tulajdonság alapján. A két tulajdonság a fehérje izoelektromos pontja és a molekulatömeg. Ez a fehérje elválasztási módszer növeli a fehérje elválasztás felbontását. A fehérje izoelektromos pontja attól a pH-tól függ, amelyen a protein semleges.

02 ábra: 2D gél elektroforézis

Így a 2D gélelektroforézis során a fehérjét rögzített pH-gradiensen hagyjuk futtatni az első dimenzióban. A második dimenzióban a fehérjéket vertikális vagy vízszintes poliakrilamid gél elektroforézissel választják el. Így a fehérjék a második dimenzió molekulatömegük szerint szétválnak.

Ezenkívül ez a gélelektroforézis-módszer növeli a fehérjeválasztás felbontását. Ezért az elválasztott fehérjék tisztábbak. A technika költsége azonban sokkal magasabb, mint az egydimenziós gélelektroforézisnél.

Milyen hasonlóságok vannak az 1D és a 2D gélelektroforézis között??

• Mindkét módszer elválasztja a fehérjéket.
• Ezért fontosak a fehérjék jellemzésében.

Mi a különbség az 1D és a 2D gél elektroforézis között??

Az 1D és 2D gélelektroforézis közötti fő különbség az, hogy az 1D gél elektroforézis csak a molekulatömeg alapján választja el a fehérjéket, míg a 2D gélelektroforézis mind a izoelektromos pont, mind a molekulatömeg alapján elválasztja a fehérjéket. Az 1D és a 2D gélelektroforézis közötti alapvető különbség miatt a fehérjék elválasztásának felbontása és a két módszer költsége is eltérő lehet. A 2D gélelektroforézis nagy felbontású, mint az 1D gélelektroforézis. A 2D gél elektroforézis azonban költségesebb, mint az 1D gél elektroforézis.

Az infographic alatt az 1D és a 2D gélelektroforézis közötti különbséget foglaljuk össze.

Összegzés - 1D és 2D gél elektroforézis

A fehérjék szétválasztása számos tényezőn alapul. Az 1D gélelektroforézis a fehérjéket csak a molekulatömeg alapján választja el. A kétdimenziós vagy 2D-es gélelektroforézis azonban növeli a fehérjeválasztás felbontását. Ezenkívül a 2D gél elektroforézis elválasztja a fehérjéket az izoelektromos pont és a molekulatömeg alapján. Ezért ezek az adatok fontosak a fehérjék későbbi feldolgozásakor és a proteomika területén. Tehát ez az 1D és 2D gélelektroforézis közötti különbség összefoglalása.

Referencia:

1. Galeva, Nadezhda és MichailAltermann. "Az egydimenziós és kétdimenziós gél elektroforézis összehasonlítása a patkány máj mikroszómák proteomikai elemzésének elválasztó eszközeként: P450 citokrómok és egyéb membránfehérjék." Proteomics, Egyesült Államok Nemzeti Orvostudományi Könyvtár, 2002. június, itt érhető el.

Kép jóvoltából:

1. „Elektroforézis - 1D gélüregek kitöltése fehérjekeverékkel”: Jean-Etienne Poirrier - Az 1D gélüregek kitöltése fehérjekeverékkel (CC BY-SA 2.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. „2D elektroforézis”: Nemzeti Egészségügyi Intézet - Rákkutató Központ Nanobiológiai Programja, Nemzeti Egészségügyi Intézet (Public Domain) a Commons Wikimedia segítségével