Különbség a bakteriális transzpozázok és a retrovírusintegrázok között

Fő különbség - baktérium Transzpozíciók vs. retrovírusintegrázok
 

A hordozható genetikai anyag két fő stratégiával fejlődött ki, hogy az egyik régióból a másikba kerüljön a genomok belsejében és között. Az egyik módszer az RNS-molekulán való kiszorítás egy DNS-molekula kialakulása előtt, míg a másik út DNS közbenső termékeket foglal magában. A transzpozíciós genetikai anyag példái a transzpozázok és a vírusintegrázok. A bakteriális transzpozázok a transzpozonok végéhez kötődnek, és különféle mechanizmusok révén megkönnyítik a transzpozon mozgását a genom másik részébe. A retrovírusos integrázok olyan enzimek, amelyek elősegítik a retrovírus genetikai anyagának, például a HIV-nek a befogadott gazdasejt genetikai anyagába (DNS-be) történő integrációját. Ez a kulcs különbség a bakteriális transzpozázok és a retrovirális integrázok között.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mik a bakteriális transzpozázok?
3. Mik a retrovírusintegrázok?
4. A bakteriális transzpozázok és a retrovírusos integrázok közötti hasonlóságok
5. Összehasonlítás - bakteriális transzpozázok vs. retrovírusos integrázok táblázatos formában
6. Összegzés

Mik a bakteriális transzpozázok??

A transzpozáz úgy definiálható, mint egy enzim, amely a transzpozonok végéhez kötődik, amelyek különféle mechanizmusok révén megkönnyítik a transzpozon mozgatását a genom másik részébe. Az ilyen mechanizmusok magukban foglalják a „kivágás és beillesztés” mechanizmust és a „replikáló átültetési mechanizmust”. A transzpozázt először a Tn3 transzpozon átültetéséhez szükséges enzim klónozásával vezettek be. Az átültethető genetikai elemek két fontos stratégiát alkalmaztak a genomok közötti vagy az egyik helyről a másikra történő áthelyezéshez. Az egyik stratégia az RNS intermedieren keresztüli transzportja a DNS-kópia szintézise előtt, míg a másik csak a DNS-intermedierekhez kötődik. A két elem integrációjában részt vevő rekombinációs reakciókra az elemspecifikus enzimek miatt kerül sor. Tehát egy DNS-elem esetében ezeket az enzimeket transzpozázoknak, míg RNS elemek esetén integrázoknak nevezzük.

Ha összehasonlítjuk a két átültetési stratégia közötti különbségeket, úgy tűnik, hogy a beiktatás folyamata kémiailag azonos. A legfrissebb bizonyítékok azonban azt sugallják, hogy az integrációs mechanizmus bizonyos hasonlóságai az aminosav-szekvenciák azon régióiban tapasztalhatók, amelyek aktív helyet képeznek; a DDE motívuma. Jelenleg öt transzpozíciós család van besorolva, de az új transzpozáz karakterekkel a családok száma még nem növekszik. A családok között szerepel a DDE-transzpozáz, a tirozin (Y) -pozitáz, a szerin (S) -pozitáz, a gördülő kör-transzpozáz, a fordított transzkriptázok / endonukleázok (RT / En) stb. A DDE-transzpozáz az eredeti transzpozon vágási és beillesztési mechanizmusába tartozik, és három sorozat konzervált aminosavat tartalmaz, nevezetesen; aszpartát (D), aszpartát (D) és glutamát (E). A tirozin-transzpozázok a kivágás és beillesztés mechanizmusában is részt vesznek tirozinmaradék felhasználásával, amely helyspecifikus.

01. ábra: Bakteriális transzpozázok

A szerin-transzpozázok kör alakú DNS-köztiterméket tartalmaznak, és a kivágás és beillesztés mechanizmusát a családhoz hasonlóan hajtják végre. A gördülő kör transzpozáz része a bemásolás mechanizmusának, ahol egyetlen szál közvetlenül a célhelyre másolódik a DNS replikációja révén. Ez biztosítja, hogy a templát- és a másolt szál egy újonnan szintetizált szálból álljon. A fordított transzkriptázok / endonukleázok transzpozáz különböző transzpozíciós mechanizmusokkal rendelkezik.

Mik a retrovírusintegrázok??

A Retrovirális Integrase összefüggésében retrovirális enzimnek tekintik, amely elősegíti a retrovírus genetikai anyagának, például a HIV-nek a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS-be) történő integrálását. Ezek a retrovírusos integrálok gyakran összekeverednek a fágintegrázokkal. A fágintegrázokra példa a λ-fágintegráz. De ezek teljesen különböző enzimek, és nem szabad összetéveszteni őket. A retrovirális integráció előtti komplex kialakulása szempontjából a retrovirális integráz játszik fő szerepet. A retrovírusos integráz fehérjék általában három (03) kanonikus domént tartalmaznak. Ezeket a domaineket rugalmas linkerek kapcsolják össze.

A három domén tartalmaz egy N terminális cinkkötő domént, ahol három spirális köteg kapcsolódik és stabilizálódik egy Zn bevonásával történő koordináció útján.²⁺ kation, RNáz H-szeres katalitikus magdomén és C-terminális DNS-kötő domén, amely SH3-szeres. Vizsgálataimmal, valamint biokémiai és szerkezeti információk alapján arra utal, hogy a retrovírusos integráz képes-e dimer-dimerként (tetramerként) működni. A multimerizáció és a vírus DNS-kötés kapcsán a retrovirális integráz fehérje mindhárom doménje. A retrovirális integráz fő funkciója genetikai anyagának beillesztése a DNS gazdaszervezetbe. Ez a lépés a HIV-vírus vírusos replikációjának legfontosabb lépése. Miután sikeresen integrálódott, ott lesz a sejt kromoszómális DNS-ében élettartama hátralévő részében.

02 ábra: Retrovírusintegrázok

Ezért az integráció után a cellának nincs visszatérése. Ezek a retrovírusos integrázok két fő reakció katalizálásában rejlenek, beleértve a 3 'végfeldolgozást és a kovalens ligálást. A 3 'vége feldolgozása során a nukleotidokat a vírus DNS mindkét 3' végéből eltávolítják azzal a céllal, hogy felfedjék a vírus DNS 3 'végeinek CA dinukleotidjait, és kovalens ligálás során a a vírus DNS-t kovalensen ligáljuk a gazda kromoszomális DNS-be.

Milyen hasonlóságot mutatnak a baktériumtranszpozázok és a retrovírusintegrázok között??

• Mind a bakteriális transzpozázok, mind a retrovírusintegrázok hasonló aminosav-szekvenciákkal rendelkeznek.

Mi a különbség a bakteriális transzpozázok és a retrovírusintegrázok között??

Bakteriális transzpozázok vs. retrovírusintegrázok
A bakteriális transzpozáz egy enzim, amely a transzpozonok végéhez kötődik, miközben különböző mechanizmusok révén megkönnyíti a transzpozon mozgását a genom másik részébe..	A retrovírusintegrázokat retrovírusos enzimnek tekintik, amely elősegíti a retrovírus genetikai anyagának, például a HIV-nek a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS-be) történő integrálását..
Kötelező régiók
Magas specifikus kötő régiókra van szükség a bakteriális transzpozázokhoz.	Kevesebb vagy semmilyen nukleotidszekvencia szükséges a kötéshez.

Összegzés - baktérium Transzpozíciók vs. retrovírusintegrázok 

A bakteriális transzpozázokat retrovírusos enzimnek tekintik, amely elősegíti a retrovírus genetikai anyagának, például a HIV-nek a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS-be) történő integrálását. Az átültethető genetikai elemek két fontos stratégiát alkalmaztak a genomok közötti vagy az egyik helyről a másikra történő áthelyezéshez. Jelenleg öt transzpozíciós család van besorolva, de az új transzpozáz karakterekkel a családok száma még nem növekszik. A retrovirális integrázt retrovirális enzimnek tekintik, amely elősegíti a retrovírus genetikai anyagának, például a HIV-nek a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS-be) történő integrálását. A retrovírusos integráz fehérjék általában három (03) kanonikus domént tartalmaznak. A retrovirális integráz fő funkciója genetikai anyagának beillesztése a DNS gazdaszervezetbe. Ez a lépés a HIV-vírus vírusos replikációjának legfontosabb lépése. Ezért az integráció után a cellának nincs visszatérése. Ez a különbség a bakteriális transzpozázok és a Retrovirális Integrase között.

Töltse le a bakteriális transzpozázok és retrovírusos integrátumok PDF-jét

Letöltheti a cikk PDF változatát, és offline célokra felhasználhatja, az idézet megjegyzésének megfelelően. Kérjük, töltse le itt a PDF verziót: Különbség a baktériumtranszpozázok és a retrovírusos integrátumok között

Referencia:

1.Vigil-Stenman, Theoden és munkatársai. "A transzpozázok magas bősége és expressziója a balti-tengeri baktériumokban." Az ISME Journal, kötet 11., nem 2017. január 11, 2611–2623. Oldal, doi: 10.1038 / ismej.2017.114.
2.Polard, P és M Chandler. „Bakteriális transzpozázok és retrovirális integrázok.” Molecular microbiology., Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Orvostudományi Könyvtára, 1995. január. Itt érhető el  
3.Andrake, Mark D. és Anna Marie Skalka. “Retrovirális integráció: Akkor és most.” Year Review of Virology, vol. 2, nem 1., 2015. szeptember, 241–264. Oldal, doi: 10.1146 / annurev-virology-100114-055043.

Kép jóvoltából:

1. 'Átültetés kivágásának és beillesztésének mechanizmusa' Gyemi Alana (CC BY-SA 4.0) a Commons Wikimedia segítségével  
2.'PDB 1wjd EBI'By Jawahar Swaminathan és az MSD munkatársai az Európai Bioinformatikai Intézetben (Public Domain) a Commons Wikimedia segítségével