Különbség a cDNS és a genomi könyvtár között

Legfontosabb különbség - cDNA vs Genomic Library
 

Két fő típusú DNS-könyvtár létezik, amelyeket a tudósok géntechnikai technikákkal állítottak elő. Ezek a cDNS könyvtár és a Genomic könyvtár. Az kulcs különbség A cDNS és a Genomic könyvtár között ez az A cDNS könyvtár tartalmazza a szervezet teljes mRNSének klónozott komplementer DNS-ét, míg a genomi DNS könyvtár a szervezet teljes genomjának klónozott fragmenseit tartalmazza. A genomi DNS könyvtár nagyobb, mint a cDNS könyvtár.

TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a cDNA könyvtár?
3. Mi a genomi könyvtár?
4. Side by side összehasonlítás - cDNA vs Genomic Library
5. Összegzés

Mi a genomi könyvtár??

A genomiális DNS könyvtár olyan klónok gyűjteménye, amelyek a szervezet teljes genomiális DNS-fragmenseit hordozzák. Ez a szervezet teljes genomiális DNS-ét tartalmazza, beleértve a kódoló és nem kódoló szekvenciákat. A genomkönyvtár felépítését a rekombináns DNS-technológiával, majd klónozással (géntechnika) hajtjuk végre. Az 01. ábrán bemutatott módon az építkezésben különböző lépések vesznek részt. A folyamat a genomi DNS izolálásával kezdődik. Megfelelő DNS-extrakciós protokoll alkalmazásával el kell különíteni a szervezet teljes genomiális DNS-ét. Ezután a DNS-t kezelhető méretűvé vagy specifikus fragmensekké kell átalakítani restrikciós endonukleázokkal (DNS-vágó enzimek). A fragmentált DNS-t be kell illeszteni a vektorokba DNS-ligázok (DNS-hez kapcsolódó enzimek) felhasználásával. A vektor egy önreplikáló szervezet. A plazmidok és bakteriofágok általában a vektorok a rekombináns DNS technológiában. Ezeket a ligált vektorokat rekombináns DNS-molekuláknak nevezzük, mivel mind a saját, mind a beépített DNS-szekvenciákat hordozzák. A rekombináns vektorokat hozzáadjuk egy gazda baktériumhoz, és úgy készítjük el, hogy a rekombináns vektorokat felvegyék a baktériumsejtben. Rekombináns vektorokkal (plazmidokkal) rendelkező baktériumokat tápközegben kell tenyészteni. A baktériumok szaporodása során a baktérium-DNS a rekombináns plazmidokkal együtt replikálja genomját és klónokat állít elő. Ezek a klónok tartalmazzák a forrás szervezet teljes genomját. Ezért genomi könyvtárnak nevezik. A plazmidok könnyen elválaszthatók a bakteriális kromoszómális DNS-től, hogy felépítsék az adott szervezet genomiális könyvtárát. Ha egy adott szervezet érdekelt géneket tartalmaz, akkor könnyen kimutatható a genomi könyvtárban molekuláris próbák (markerek) hibridizációjával..

A genomi könyvtárak fontos szerepet játszanak a genom szerkezetének és működésének, a specifikus gének, a gén helyének, a gén feltérképezés, a mutációk, a gén szekvenálás, az új terápiás gének azonosítása stb. Vizsgálatában..

Ábra: Egy genomi könyvtár felépítése

Mi az a cDNS könyvtár??

A cDNS könyvtár egy komplementer DNS (cDNS) klónok gyűjteménye, amelyet egy szervezet teljes mRNS-éből szintetizálunk. Az építési eljárás különböző lépéseket foglal magában. Az első lépés a teljes mRNS tisztítása egy organizmusból. Az izolált mRNS-t cDNS-szálakká alakítják egy fordított transzkripciónak nevezett eljárással. A reverz transzkripciót egy fordított transzkriptáznak nevezett enzim segíti elő. Egy kicsi 3 'láncindítót használ, és elindítja az első cDNS szál szintézisét, komplementerként az templátos mRNS szálhoz. A kapott kettős szálú cDNS-t restrikciós endonukleázok felhasználásával kisebb fragmentumokká konvertáljuk, és megfelelő vektorokba illesztjük. Ezeket a konstruált rekombináns molekulákat azután hozzáadjuk egy gazdaszervezethez, és tenyészközegben növesztjük klónok előállítása céljából. A szervezet cDNS-fragmenseit tartalmazó klónok gyűjteménye cDNS könyvtár. A teljesen szeletelt érett mRNS nem tartalmaz introneket és szabályozó régiókat. Ezért a cDNS könyvtárakban nem a nem kódoló fragmensek nem vannak jelen, ellentétben a genomi könyvtárral.

A cDNS könyvtárak fontosak a kódoló régiók, a génfunkciók, a gének expressziója stb. elemzésében.

Ábra: cDNS könyvtár felépítése

Mi a különbség a cDNS és a Genomic Library között??

cDNS vs Genomic Library
A cDNS könyvtár azon klónok gyűjteménye, amelyek a szervezet mRNS-ének komplementer DNS-ét hordozzák	A genomi könyvtár egy klónok gyűjteménye, amely a szervezet teljes genomiális DNS-ét tartalmazza.
Kódolás vs nem kódoló szekvenciák
A cDNS könyvtár csak a kódoló szekvenciákat tartalmazza; nem tartalmaz intront.	A genomi könyvtár a teljes genomi DNS-ből áll, beleértve a nem kódoló (intronokat és szabályozó) DNS-t is.
Méret
A cDNS könyvtár kicsi.	A genomi könyvtár nagy.
Kiindulási anyag
A kiindulási anyag az mRNS	A kiindulási anyag a DNS.
A fordított transzkripció bevonása.
Az első cDNS szál szintézisében fordított transzkripció történik.	Nem fordul elő transzkripció.

Összegzés - cDNS és genomi könyvtár

A genomi könyvtár egy klón populációját képviseli, amely egy szervezet fragmentált teljes genomiális DNS-ét viseli. A cDNS könyvtár egy szervezet teljes mRNS komplementer DNS-ét hordozó klónok populációját képviseli. A cDNS-klón csak az mRNS-ben található szekvenciákat tartalmazza, míg a genomi klón a teljes genom szekvenciáit tartalmazza. Ez a különbség a cDNS és a genomi könyvtár között.

Referencia:
1. Haneef, Deena T KochunniJazir. "Különbség a genomiális és a cDNA könyvtár között." Különbség a genomiális és a cDNS könyvtár között. N.p., n.d. Web. 2017. február 15
2. Stekel, Dov J., Yoav Git és Francesco Falciani. "A gén expresszió összehasonlítása több cDNS könyvtárból." Genomkutatás. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2000. december. Web. 2017. február 16
3. „Az Escherichia coli n-butanol-toleranciában részt vevő gének genomikus könyvtári képernyői.” Az Escherichia coli-ban az n-butanol-toleranciában részt vevő gének genomikus könyvtári képernyői. N.p., n.d. Web. 2017. február 16

Kép jóvoltából:
1. PhD Dre „cDNA könyvtár kialakítása” az angol nyelvű Wikipedia-ban (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. A „Genomikus könyvtár felépítése” Aluquette által - Saját munka (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével