Különbség a FISH és a CGH között

Az kulcs különbség a FISH és a CGH között ez A FISH egy olyan molekuláris módszer, amely fluoreszcensen jelölt próbákkal detektálja a kromoszómán egy specifikus DNS-szekvenciát, míg a CGH egy másik molekuláris citogenetikai módszer, amely detektálja a genomi DNS változásait.

A citogenetikai elemzés fontos szerepet játszik az orvostudományban a kromoszóma rendellenességek, például aneuploidiumok, deléciók, duplikációk és átrendeződések stb. Kimutatásában. A kromoszómális rendellenességek végül genetikai betegségekhez vezetnek, mint például rák, meddőség, Down-szindróma, Klinefelter-szindróma, Turner-szindróma, leukémia stb. Különböző molekuláris citogenetikai módszerek vannak a fent említett hibák és betegségek kimutatására. Ezek közül a FISH (fluoreszcens in situ hibridizáció) és a CGH (összehasonlító genomi hibridizáció) két hatékony hibridizációs technika. Ennek ellenére mindkét módszernek vannak előnyei és hátrányai.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a hal? 
3. Mi a CGH?
4. hasonlóságok a FISH és a CGH között
5. Összehasonlítás - FISH vs CGH táblázatos formában
6. Összegzés

Mi a hal??

A FISH egy nukleinsav-hibridizációs technika, amelyet a szövet egy részén vagy szakaszán, a teljes szövetben vagy sejtekben hajtanak végre. Ez egy szonda alapú módszer. A módszer a Watson Crick komplementer bázispárosítás elméletétől függ, vagyis DNS-DNS-hibrideket vagy DNS-RNS-hibrideket eredményez, amelyek ily módon képes mutáns géneket detektálni vagy azonosítani az érdeklődő gént. Ezen túlmenően ez a technika egyszálú DNS-szekvenciákat, kettős szálú DNS-szekvenciákat, egyszálú RNS-szekvenciákat vagy szintetikus oligonukleotidot alkalmaz, amelyet nick-transzláció alkalmazásával állítottak elő olyan próbákként, amelyek komplementerek a kérdéses génszekvenciákhoz. Ezen túlmenően, ennek a technikanak a legfontosabb jellemzője a próbák fluoreszcens festékkel való címkézése. Így a próbák a kromoszóma komplementer részeivel kötődnek és megkönnyítik a kimutatást.

Ezenkívül a FISH nagyon érzékeny és specifikus módszer. Ezért ez a módszer a hematológiai rosszindulatú daganatok és a szilárd daganatok kutatásában és diagnosztizálásában egyaránt. De a FISH alacsony felbontást mutat. A szonda szekvenciák megtervezéséhez előzetes ismereteket is igényel a cél rendellenességeiről.

01. ábra: HAL

A FISH-nak számos felhasználása van, elsősorban a fertőző betegségek molekuláris diagnosztikájában a kórokozók jelenlétének azonosítása és a kórokozó molekuláris diagnosztikával történő megerősítése érdekében. Ezenkívül a FISH általánosan használt technika a fejlődési biológia, a kariotípus és a filogenetikai elemzés, valamint a kromoszómák fizikai feltérképezése területén..

Mi az a CGH??

Az összehasonlító genomi hibridizáció (CGH) egy másik DNS-alapú molekuláris citogenetikai módszer, amely képes kimutatni a genomi DNS szekvenciák változásait. Ez a módszer egy fejlett módszer, amely elemezheti a kromoszóma és a gén módosításait a genomi DNS-szekvenciákban bekövetkező változások vagy változások kimutatására. Ezenkívül a CGH megköveteli a DNS izolálását és fragmentálását a kísérleti mintából és a referencia mintából. Ezután a mintákat két különböző fluoreszcens festékkel (általában piros és zöld) kell felcímkézni. Később mindkét mintát összekeverik, és lehetővé teszik a versenyképes hibridizációt. Az utolsó lépés a minták elemzése a DNS olyan változásait illetően, mint például a géndupláció, a génveszteség stb. Különösen a vizsgált minta és a kontrollminta közötti DNS-példányszám-különbségeket méri..

02 ábra: CGH

A CGH másik verziója már elérhető; ez fejlettebb módszer, mint a normál CGH. Ez egy technika, amelyet tömb alapú CGH-nak vagy aCGH-nak hívnak. Az aCGH lehetővé teszi a gén- vagy szekvencia-deléciók pontos azonosítását sok ezer szekvenciában egyetlen kísérletben.

Milyen hasonlóságok vannak a FISH és a CGH között??

• A FISH és a CGH két molekuláris módszer.
• Mind a FISH, mind a CGH a nukleinsav-hibridizációra támaszkodik.
• Ezenkívül mindkét módszerhez tervezett próbákat kell kidolgozni a specifikus DNS-célok detektálására.
• A genetikai betegségek prenatális és postnatalis diagnosztizálására használjuk őket.
• Ezenkívül mind a FISH, mind a CGH nagyon hatékony eszköz a genomiális változások tanulmányozására.
• Fluoreszcens festékeket használnak a szonda címkézésére.

Mi a különbség a FISH és a CGH között??

A FISH egy in situ hibridizációs eljárás, amely fluoreszcens próbákat alkalmaz a specifikus DNS-szekvenciák kimutatására, míg a CGH egy molekuláris hibridizációs technika, amely kimutatja a genomi DNS-szekvenciák változásait. Szóval, ez a legfontosabb különbség a FISH és a CGH között.

Ezenkívül a FISH megköveteli a próba szekvenciák megtervezéséhez a cél rendellenességeinek előzetes ismereteit, míg a CGH nem igényel előzetes ismereteket. A FISH és a CGH közötti további különbség az is, hogy a FISH korlátozott felbontású, míg az aCGH nagy felbontású.

Az alábbi infographic összefoglalja a FISH és a CGH közötti különbséget.

Összegzés - FISH vs CGH

A FISH és a CGH két olyan molekuláris citogenetikai módszer, amelyek megkönnyítik a kérdéses génszekvenciák kimutatását. A FISH megkönnyíti a specifikus DNS-szekvencia kimutatását egy kromoszómán fluoreszcensen jelölt próbákkal, míg a CGH megkönnyíti a genomi DNS-ben bekövetkező változások kimutatását. Szóval, ez a legfontosabb különbség a FISH és a CGH között.

Referencia:

1. „Fluoreszcencia helyzeti hibridizációban (FISH)”. A Nature News, a Nature Publishing Group elérhető itt.
2. Hester, Susan D és munkatársai. "A összehasonlító genomi hibridizációs technológiák összehasonlítása a Microarray platformon." A Biomolekuláris Technikák Újsága: JBT, a Biomolekuláris Erőforrás Szolgáltatások Szövetsége, 2009. április, elérhető itt.

Kép jóvoltából:

1. „Multiplex ViewRNA FISH vizsgálat Jurkat és HeLa sejtekben”: Ryan Jeffs - Saját munka (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. „CGH séma”: Mbaudis (beszéd) (feltöltések) - Saját munka (CC BY 2.5) a Commons Wikimedia segítségével