Különbség az előre és a hátsó alapozó között

Fő különbség - Előre vs fordított alapozó
 

A polimeráz láncreakció (PCR) egy DNS amplifikációs módszer, amelyet a molekuláris biológiai alkalmazásokban használnak. Ez egy általánosan használt technika, amely egy-egy különösen érdeklődő DNS-szekvencia másolatainak millióit-milliárd példányát eredményezi. Ez egy in vitro laboratóriumokban végzett módszer. A PCR-technika teljesen függ a kereskedelemben előállított Taq-polimeráznak nevezett DNS-polimeráztól. Ezenkívül számos más alkatrészt és megfelelő hőmérsékleti karbantartást igényel. Az egyik fontos alkotóelem a primerek. A primerek azok a rövid DNS-szekvenciák, amelyeket kifejezetten a cél-DNS-szekvencia számára terveztek. Ezek általában körülbelül 20 nukleotid hosszúak. A Taq polimeráz katalizálja a nukleotidok hozzáadását a már létező nukleotidszekvenciákba. Ezért a primereket szolgálják az új szálak szintézisének kiindulási pontjaiként. A Taq polimeráz csak 5 '- 3' irányban működik, így a DNS szintézis ugyanabban az 5 '- 3' irányban zajlik. Mivel a DNS kettős szálú, a PCR-ben kétféle primert kell használni. Ezeket előremenő és fordított alapozóként ismerik. Az előre és a fordított primereket a primer DNS-ben való meghosszabbításának iránya alapján nevezzük, amikor a DNS szintézis megtörténik. A primer előre kiképzi az antiszensz DNS szálat, és megindítja a gén + ve szálának 5 '- 3' irányba történő szintézisét. A fordított láncindító érzésteleníti a szensz szálat, és megindítja a kódoló szál komplementer száljának szintézisét; amely a gén szálát 5'-3'-irányba fordítja. Ez a kulcs különbség az előremenő és a fordított alapok között.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a Forward Primer?
3. Mi az a fordított alapozó?
4. hasonlóságok a Forward és a Reverse Primer között
5. Összehasonlítás egymással - előre és hátra alapozó táblázatos formában
6. Összegzés

Mi a Forward Primer??

Az előre orientáció a gént kódoló szál vagy szensz szál szintézise. A Taq polimeráz katalizálja egy új szál szintézisét 5 '- 3' irányban. A kódoló szál szintézise akkor fordul elő, amikor az alapozó a nem kódoló vagy az antiszensz szálhoz kapcsolódik és 5 '- 3' irányban meghosszabbodik.

01. ábra: Előre és hátra alapozók

Az antiszensz szálakkal vagy a nem kódoló szálakkal vagy a templátszálakkal lágyuló primert előremenő primernek nevezzük, mivel az előremenő primer kiindulási pontként szolgál a gén kódoló vagy pozitív szálának szintéziséhez. Az előreindító rövid nukleotidszekvenciával rendelkezik, amely komplementer az antiszensz szál 3'-oldalával. Hibridizál az antiszensz szálakkal és megkönnyíti a Taq polimerázt, hogy nukleotidokat hozzon létre, amelyek komplementer a templát szálhoz.

Mi az a fordított alapozó??

A fordított primer a rövid DNS-szekvencia, amely a szensz szál vagy a kódoló szál 3'-végével hevít. A fordított láncindító kiindulási pontként szolgál a kódoló szekvencia vagy a nem kódoló szekvencia komplementer szálának szintéziséhez. A fordított primer a kódoló szál 3'-végével kiegészítve van kialakítva. Ezért megkeményedik a kódoló szál szegélyező 3 'végével, és lehetővé teszi a Taq polimeráz számára az antiszensz szál vagy a templát szál szintetizálását. Mivel orientációja fordított irányban történik, ezt az alapozót fordított alapozóként jelölik.

Mind a reverz, mind a forward primerek fontosak a megcélzott vagy érdeklődő DNS bizonyos régiók több millió-milliárd példányának elkészítéséhez.

Milyen hasonlóságok vannak a hátsó és a hátsó alapozó között??

  • Mind a Forward, mind a Reverse primerek oligonukleotidokból készülnek.
  • Mind a kezdő, mind a fordított primerek rövid nukleotidszekvenciával rendelkeznek, kiegészítve a DNS kettős szálának szomszédos végeivel.
  • Mind a Forward, mind a Reverse primerek általában 20 nukleotidból állnak.
  • A polimeráz láncreakciókban mind az előre, mind a fordított primereket használják.
  • Mind a Forward, mind a Reverse primereket szintetizálják a kereskedelemben.
  • Mind a Forward, mind a Reverse primerek hőmérsékleten stabilak, és általában hasonló Tm-rel rendelkeznek.
  • Mind a kezdő, mind a fordított primereket a cél-DNS-szekvenciákkal lágyítják el.
  • Mind a Forward, mind a Reverse primereket a PCR reakciók szerint tervezték.
  • A DNS-amplifikáció kiindulási pontjaként mind az előremeneti, mind a fordított primereket használják.
  • Mind a reverz, mind a forward primerek fontosak a megcélzott vagy érdekelt DNS-szekvenciák bizonyos régióinak millió példányának előállításához.

Mi a különbség az előre és a hátsó alapozó között??

Forward Primer vs Reverse Primer

Az előreindító rövid szekvencia, amely hibridizálódik a nem kódoló 3'-végével vagy a gén templátszálával, és kiindulási pontként szolgál a kódoló szekvencia szintetizálásához. A fordított primer a rövid DNS-szekvencia, amely hibridizálódik a kódoló 3 'végével vagy a nem-templátos szálgal, és kiindulási pontként szolgál a nem kódoló szekvencia szintéziséhez.
 Meggyógyító Strand
Előzetes primer fogolások sablon szálral. Fordítsuk meg az alapozó lágyítását a nem-templát szálral.
Eredményes új sorozat
Az előremenő primer megkönnyíti a kódoló szekvencia szintézisét. A fordított primer megkönnyíti a nem kódoló szekvencia szintézisét.

Összegzés - Előre vs fordított alapozó

Kétféle primert lehet bevonni a PCR technikába. Ezek előre- és fordított primerek. A primer meghosszabbítása alapján az új DNS-szál szintézisben ezeket a primereket jelöljük vagy megnevezzük. A Taq polimeráz az új DNS-t 5 '- 3' irányban szintetizálja. Ezért az alapokat úgy tervezték, hogy kiegészítsék a kettős szál 3'-végét. Az 5 '- 3' irányban meghosszabbító előremenő primer hibridizálódik az antiszensz 3 'végével vagy a templátdal vagy a nem kódoló szekvenciával. Kiindulási pontként szolgál a kódoló szekvencia szintetizálásához. Az 5 '- 3' irányban meghosszabbodó fordított primer hibridizálódik a kódolás 3 'végével vagy a nem-templátummal, vagy az szensz szálral. Kiindulási pontként szolgál a nem kódoló szekvencia szintetizálásához. Ez a különbség az előre és a fordított alapozó között.

Referencia:

1. „Primer (molekuláris biológia).” Wikipedia, Wikimedia Alapítvány, 2018. február 20. Elérhető itt 
2. “Polimeráz láncreakció (PCR).” Khan Akadémia. Itt érhető el 

Kép jóvoltából:

1.'Primers RevComp Melted2'By Richard Wheeler (Zephyris) - Saját munka, (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia-on keresztül