A polimeráz láncreakció (PCR) egy DNS amplifikációs módszer, amelyet a molekuláris biológiai alkalmazásokban használnak. Ez egy általánosan használt technika, amely egy-egy különösen érdeklődő DNS-szekvencia másolatainak millióit-milliárd példányát eredményezi. Ez egy in vitro laboratóriumokban végzett módszer. A PCR-technika teljesen függ a kereskedelemben előállított Taq-polimeráznak nevezett DNS-polimeráztól. Ezenkívül számos más alkatrészt és megfelelő hőmérsékleti karbantartást igényel. Az egyik fontos alkotóelem a primerek. A primerek azok a rövid DNS-szekvenciák, amelyeket kifejezetten a cél-DNS-szekvencia számára terveztek. Ezek általában körülbelül 20 nukleotid hosszúak. A Taq polimeráz katalizálja a nukleotidok hozzáadását a már létező nukleotidszekvenciákba. Ezért a primereket szolgálják az új szálak szintézisének kiindulási pontjaiként. A Taq polimeráz csak 5 '- 3' irányban működik, így a DNS szintézis ugyanabban az 5 '- 3' irányban zajlik. Mivel a DNS kettős szálú, a PCR-ben kétféle primert kell használni. Ezeket előremenő és fordított alapozóként ismerik. Az előre és a fordított primereket a primer DNS-ben való meghosszabbításának iránya alapján nevezzük, amikor a DNS szintézis megtörténik. A primer előre kiképzi az antiszensz DNS szálat, és megindítja a gén + ve szálának 5 '- 3' irányba történő szintézisét. A fordított láncindító érzésteleníti a szensz szálat, és megindítja a kódoló szál komplementer száljának szintézisét; amely a gén szálát 5'-3'-irányba fordítja. Ez a kulcs különbség az előremenő és a fordított alapok között.
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a Forward Primer?
3. Mi az a fordított alapozó?
4. hasonlóságok a Forward és a Reverse Primer között
5. Összehasonlítás egymással - előre és hátra alapozó táblázatos formában
6. Összegzés
Az előre orientáció a gént kódoló szál vagy szensz szál szintézise. A Taq polimeráz katalizálja egy új szál szintézisét 5 '- 3' irányban. A kódoló szál szintézise akkor fordul elő, amikor az alapozó a nem kódoló vagy az antiszensz szálhoz kapcsolódik és 5 '- 3' irányban meghosszabbodik.
01. ábra: Előre és hátra alapozók
Az antiszensz szálakkal vagy a nem kódoló szálakkal vagy a templátszálakkal lágyuló primert előremenő primernek nevezzük, mivel az előremenő primer kiindulási pontként szolgál a gén kódoló vagy pozitív szálának szintéziséhez. Az előreindító rövid nukleotidszekvenciával rendelkezik, amely komplementer az antiszensz szál 3'-oldalával. Hibridizál az antiszensz szálakkal és megkönnyíti a Taq polimerázt, hogy nukleotidokat hozzon létre, amelyek komplementer a templát szálhoz.
A fordított primer a rövid DNS-szekvencia, amely a szensz szál vagy a kódoló szál 3'-végével hevít. A fordított láncindító kiindulási pontként szolgál a kódoló szekvencia vagy a nem kódoló szekvencia komplementer szálának szintéziséhez. A fordított primer a kódoló szál 3'-végével kiegészítve van kialakítva. Ezért megkeményedik a kódoló szál szegélyező 3 'végével, és lehetővé teszi a Taq polimeráz számára az antiszensz szál vagy a templát szál szintetizálását. Mivel orientációja fordított irányban történik, ezt az alapozót fordított alapozóként jelölik.
Mind a reverz, mind a forward primerek fontosak a megcélzott vagy érdeklődő DNS bizonyos régiók több millió-milliárd példányának elkészítéséhez.
Forward Primer vs Reverse Primer | |
Az előreindító rövid szekvencia, amely hibridizálódik a nem kódoló 3'-végével vagy a gén templátszálával, és kiindulási pontként szolgál a kódoló szekvencia szintetizálásához. | A fordított primer a rövid DNS-szekvencia, amely hibridizálódik a kódoló 3 'végével vagy a nem-templátos szálgal, és kiindulási pontként szolgál a nem kódoló szekvencia szintéziséhez. |
Meggyógyító Strand | |
Előzetes primer fogolások sablon szálral. | Fordítsuk meg az alapozó lágyítását a nem-templát szálral. |
Eredményes új sorozat | |
Az előremenő primer megkönnyíti a kódoló szekvencia szintézisét. | A fordított primer megkönnyíti a nem kódoló szekvencia szintézisét. |
Kétféle primert lehet bevonni a PCR technikába. Ezek előre- és fordított primerek. A primer meghosszabbítása alapján az új DNS-szál szintézisben ezeket a primereket jelöljük vagy megnevezzük. A Taq polimeráz az új DNS-t 5 '- 3' irányban szintetizálja. Ezért az alapokat úgy tervezték, hogy kiegészítsék a kettős szál 3'-végét. Az 5 '- 3' irányban meghosszabbító előremenő primer hibridizálódik az antiszensz 3 'végével vagy a templátdal vagy a nem kódoló szekvenciával. Kiindulási pontként szolgál a kódoló szekvencia szintetizálásához. Az 5 '- 3' irányban meghosszabbodó fordított primer hibridizálódik a kódolás 3 'végével vagy a nem-templátummal, vagy az szensz szálral. Kiindulási pontként szolgál a nem kódoló szekvencia szintetizálásához. Ez a különbség az előre és a fordított alapozó között.
1. „Primer (molekuláris biológia).” Wikipedia, Wikimedia Alapítvány, 2018. február 20. Elérhető itt
2. “Polimeráz láncreakció (PCR).” Khan Akadémia. Itt érhető el
1.'Primers RevComp Melted2'By Richard Wheeler (Zephyris) - Saját munka, (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia-on keresztül