Különbség a gél elektroforézis és az SDS között

Fő különbség - gél elektroforézis vs SDS
 

A gélelektroforézis olyan módszer, amely elválasztja a makromolekulákat elektromos térben. A molekuláris biológiában általános módszer a DNS, RNS és fehérjék elkülönítése a keverékekből molekuláris méretük szerint. Az SDS Page egy olyan típusú gélelektroforézis, amelyet a fehérjéknek a fehérjekeverékből való méretük alapján történő elválasztására használnak. A gélelektroforézis a DNS, RNS és fehérje elválasztására alkalmazott szokásos módszerre utal míg Az SDS Page egyfajta gélelektroforézis. Ez a legfontosabb különbség a gél elektroforézis és az SDS oldal között.

TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a gél elektroforézis?
3. Mi az SDS oldal
4. Összehasonlítás egymással - Gél elektroforézis vs SDS oldal
5. Összegzés

Mi az a gél elektroforézis??

A gélelektroforézis a laboratóriumokban általánosan alkalmazott módszer a töltött molekulák, például DNS, RNS, fehérjék stb. Elválasztására a keverékeikből. Gélt alkalmaznak a gél elektroforézis során. Molekuláris szitaként működik. A gél elektroforézisében kétféle gél létezik, nevezetesen agaróz és poliakrilamid. A gél kiválasztása és a gélkészítmény fontos tényezők, amelyeket figyelembe kell venni a gélelektroforézis során, mivel a gél pórusméretét gondosan kell manipulálni a molekulák jó elválasztása érdekében gélelektroforézissel. A gél elektroforézisének elektromos tere van a gél két végéhez csatlakoztatva. A gél egyik vége pozitív töltést mutat, míg a másik vége negatív töltést mutat.

A DNS és az RNS negatív töltésű molekulák. Miután behelyezték a gélbe a gél negatív végétől és felvisszék az elektromos mezőre, áthatolnak a gél pórusaiin a gél pozitívan töltött vége felé. A migráció sebessége a töltéstől és a molekula méretétől függ. Kisebb molekulák könnyen vándorolnak a gél pórusán, mint a nagyobb molekulák. Ezért a kisebb molekulák nagy távolságra haladnak a gélen, a nagyobb molekulák pedig rövid távolságra haladnak. A molekulák gélen való mozgásának megfigyelésére különleges típusú festékeket használnak. Az elektromos mezőt egy bizonyos ideig alkalmazzák, és leállítják, hogy megakadályozzák a molekulák elvesztését és megtartják a molekulákat mozgó helyzetükben. Különböző sávok figyelhetők meg a gélben. Ezek a sávok különböző méretű molekulákat képviselnek. Ezért a gélelektroforézis hasznos a molekulák méretének megkülönböztetésére.

A gél-elektroforézist beépítették a molekuláris biológiában alkalmazott különféle módszerekbe, mint preparatív technikákat, mint például a PCR, RFLP, klónozás, DNS-szekvenálás, déli blotolás, genomtérkép stb..

01. ábra: Agaróz gél elektroforézis

Mi az SDS oldal??

Nátrium-dodecil-szulfát-poliakrilamid-gél elektroforézis (SDS oldal) egy olyan típusú gélelektroforézis, amelyet a fehérjék elválasztására használnak. Ha a gélelektroforézist elválasztják a fehérjékről, akkor speciális kezelésekre van szükség, mivel a fehérjék nem vannak negatív töltésű, mint például a DNS és az RNS, és nem mozognak a pozitív vagy negatív vége felé. Ezért a fehérjék denaturálódnak és negatív töltéssel vannak bevonva a gélelektroforézis előtt. Ezt egy nátrium-dodecil-szulfát (SDS) nevű mosószer alkalmazásával készítik. A hordozó közeghez SDS-t és poliakril-amid gélt használó gélelektroforézis SDS oldal. Ezt a technikát általában használják a biokémiai, genetikai, kriminalisztikai és molekuláris biológiában.

Az SDS oldal során a fehérjéket összekeverik az SDS-sel. Az SDS a fehérjéket lineáris alakba bontja és a molekulatömegükhöz arányos negatív töltéssel bevonja őket. A negatív töltés miatt a fehérjemolekulák a gél pozitív töltésű vége felé vándorolnak, és molekulatömegük szerint szétválnak. Az SDS oldalon a poliakrilamidot használják a gél szilárd hordozójaként. A fehérjék tényleges elválasztása elsősorban a gél tulajdonságaitól függ. Ezért a poliakrilamid gél előkészítését gondosan el kell végezni, és a megfelelő poliakrilamid koncentrációkat kell használni. A poliakrilamid gélek nagy felbontásúak, mint az agaróz gélek. Ezért az SDS oldalt nagy felbontású technikának tekintik a fehérje elválasztáshoz.

Az SDS oldal egy denaturáló gél elektroforézis típusa. Ennek jelentős korlátozása van a fehérjeelemzésben. Mivel az SDS a szétválasztás előtt denaturálja a fehérjéket, nem teszi lehetővé az enzimatikus aktivitás, a fehérjekötő kölcsönhatások, a fehérje kofaktorok stb. Kimutatását..

02 ábra: SDS oldal

Mi a különbség a gél elektroforézis és az SDS között??

Gél elektroforézis vs SDS
A gél elektroforézis egy módszer, amelyet a makromolekulák elválasztására végeznek elektromos mező felhasználásával.	Az SDS Page nagy felbontású gélelektroforézis technika, amelyet a fehérjék tömegük alapján történő elválasztására használnak.
Gel Run
Vízszintesen vagy függőlegesen is végrehajtható.	Az SDS oldal mindig függőlegesen fut.
Az elválasztás alapja
Az elválasztás a töltés és a méret szerint történik.	A fehérje elválasztása a tömeg és a töltés szerint történik.
Felbontás
Az agaróz gél elektroforézis alacsony felbontású, a poliakrilamid gél elektroforézis nagyobb felbontású	Az SDS oldal jobb felbontású.
Denaturáiás
A gél elektroforézis magában foglalja mind a denaturálási, mind a nem denaturálási technikákat.	Az SDS-oldal denaturálja a fehérjéket az elválasztás előtt.

Összegzés - Gél elektroforézis vs SDS

A gélelektroforézis egy általános módszer a DNS, RNS és fehérjék elválasztására és elemzésére méretük és töltésük alapján. A gélelektroforézisnek két fő típusa van, nevezetesen az agaróz gélelektroforézis és a poliakrilamid gélelektroforézis. Az agarózgéleket főként a nukleinsav-elválasztásra használják; ha nagyobb felbontásra van szükség, poliakrilamid géleket használunk. Az SDS Page egy olyan típusú gélelektroforézis, amelyet általában alkalmaznak a fehérjék komplex keverékeinek elválasztására. Nagy felbontású protein elválasztási technikának tekintik. Ez a különbség a gél elektroforézis és az SDS oldal között.

Irodalom:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig és David H. Petering. Natív SDS-PAGE: A fehérjék nagyfelbontású elektroforetikus szétválasztása a natív tulajdonságok megtartásával, beleértve a kötött fémionokat. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., 2014. május. Web. 2017. április 7
2. Stellwagen, Nancy C. “A DNS elektroforézise agarózgélben, poliakrilamid gélben és szabad oldatban.” Elektroforézis. Az Egyesült Államok Nemzeti Orvostudományi Könyvtára, 2009. június. Web. 2017. április 7

Kép jóvoltából:
1. „Gelelektrophoreseapparatur” (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. „Agarose gél elektroforézis” Ann Arbor Természeti Erőforrások Iskolájában - DNS-laboratórium (CC BY 2.0) a Commons Wikimedia-on keresztül