Különbség a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása között

Az kulcs különbség a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása között az, hogy a A genomiális DNS-izolálás a genomiális DNS-extrakciót célozza, míg a plazmid-DNS-izolálás a baktériumok plazmid-DNS-extrakcióját célozza meg..

A DNS izolálása egy kémiai folyamat, amelyet különféle fajokból vagy különböző mintákból származó DNS izolálására használnak. A DNS izolálása fontos a downstream molekuláris biológiai technikákban, mint például a gélelektroforézis, a polimeráz láncreakció és a DNS szekvenálási technikák. Ezért a DNS izolálása alapvető kémiai folyamat a molekuláris biológiai vizsgálatok során. A kutatás célja alapján néha el kell különíteni a genomi DNS-t. Ezenkívül néhány tanulmány a plazmid DNS baktériumoktól történő izolálására összpontosít. A genomi DNS izolálása a genomi DNS izolálásának folyamata prokarióta vagy eukarióta mintából. Az izolálás lépései azon sejt típusától függnek, amelyben a DNS izolálódik. A plazmid DNS izolálása a plazmid DNS izolálása egy baktériumsejtből. A genomiális DNS-izolációval összehasonlítva a plazmid-DNS-izolálás teljes folyamata összetett.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a genomi DNS-izolálás?
3. Mi a plazmid DNS izolálása?
4. A genomi DNS és a plazmid DNS izolálása közötti hasonlóságok
5. Side by side összehasonlítás - genomi DNS vs. plazmid DNS izolálás táblázatos formában
6. Összegzés

Mi a genomi DNS-izolálás??

A genomi DNS-izolálás a szervezet teljes genomiális DNS-ének extrahálásának folyamata. Ez a folyamat három fő eseményt foglal magában. Ezek a sejt lízis vagy nukleáris lízis, fehérje lebontás vagy proteolízis és a genomi DNS kicsapódása. A lízis lépése a sejt típusától függően változhat. A prokariótákban, mivel van egy peptidoglikán sejtfal, az első lépés a sejtfal lebontása. Másrészt, az eukariótákban a lízis lépése során a plazmamembrán és a nukleáris membrán lebontásra kerül, hogy a DNS-t kifelé szállítsák. Ezzel szemben a növényi és gombás sejtfalak lizálásához elengedhetetlenek a különleges lépések.

01. ábra: Genomi DNS izolálás

Következésképpen, amint a lízis befejeződik, a DNS végül a felülúszóba kerül. Ezzel egyidejűleg a protein lebomlása az oldatban a proteináz K hozzáadása miatt is zajlik. Következő lépés a genomi DNS és a lebontott proteinek elválasztása egymástól. Ezért a lebontott fehérjék kicsapással szétválnak, lehetővé téve a genomi DNS maradását a felülúszóban. A fehérjék kicsapódása után a genomi DNS kicsapódhat és egy megfelelő pufferben szuszpendálható, amíg ez a kísérlethez szükséges.

A genomi DNS, amely lineáris DNS tartalmazza a szervezet összes genetikai információját. Más szavakkal, a genom az élő szervezet örökletes anyaga, amely felelős a sejt összes szerkezeti és funkcionális aktivitásáért. Mind kódoló, mind nem kódoló DNS-szekvenciákból áll. A genomi DNS izolálásakor magában foglalja a szervezet teljes genomját.

Mi az a plazmid DNS izolálás??

A plazmid DNS-izolálás a DNS-izolálás különleges és bonyolultabb folyamata. A plazmidok a legtöbb baktériumsejtben jelen vannak extrakromoszómális DNS-ek. Ezek nyugalmi kör alakú DNS-ek, amelyek elősegítik a baktériumok életét súlyos környezeti feltételek mellett. A plazmid-DNS speciálisan rezisztens génekből áll, amelyek további előnyöket biztosítanak a baktériumok számára, például antibiotikum-rezisztencia, virulencia tulajdonságok és toxikus tulajdonságok.

02 ábra: Plazmid DNS izolálása

A plazmid DNS izolálása három fő folyamatot foglal magában; sejtlízis, proteinolízis és DNS kicsapódás. Noha az izolálás biokémiai mechanizmusa hasonló a genomi DNS-izoláláshoz, a folyamat sokkal összetettebb. Ebben az eljárásban a sejtlízis a legfontosabb folyamat. A legfontosabb, hogy a genomiális DNS-t és a plazmid-DNS-t nem szabad keverni egymással. Ezért egy sokkal enyhébb lízis folyamat beépül a plazmid DNS izolációs eljárásába. Ezért a legtöbb plazmid DNS-izolálási eljárásban a mosószert használja; nátrium-dodecil-szulfát a sejtlízishez.

Milyen hasonlóságok vannak a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása között??

• A genomi DNS és a plazmid DNS izolálása a szervezet DNS extrahálására összpontosít.
• Ezenkívül mindkettő ugyanazt az általános eljárást követi, amely magában foglalja a sejtek lízisét, a fehérje lebontását és a DNS kicsapását.
• Ezenkívül a mindkét folyamatból származó DNS fontos a későbbi folyamatokban.
• Ezenkívül mindkét izolációs eljárás tartalmazza a DNS tisztítását és tárolását meghatározott tárolási körülmények között.
• Ezenkívül a proteináz K-t mindkét módszerben alkalmazzák a fehérjék lebontására.

Mi a különbség a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása között??

A genomiális DNS-izolálás a célszervezet teljes genomiális DNS-ének extrahálására koncentrál, míg a plazmid-DNS-izolálás csak a plazmid-DNS izolálására összpontosít az adott baktériumfajból. Ezért ez a legfontosabb különbség a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása között. Ezenkívül a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása között egy másik különbség van az eljárásban. A genomi DNS-izolálás kevésbé bonyolult eljárás, mint a plazmid DNS-izolálás. Ezért a plazmid DNS izolálásakor óvintézkedéseket kell tenni annak megakadályozására, hogy a genomi és a plazmid DNS keveredjen egymással.

Az alábbi infográfiai adatok további részleteket tartalmaznak a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása közötti különbségről.

Összegzés - genomi DNS vs. plazmid DNS izolálás

A DNS izolálása fontos folyamat a molekuláris biológiai technikákban. Kétféle DNS van, nevezetesen genomi DNS és plazmid DNS (extra-kromoszómális DNS). A követelmény alapján néhány eljárás a genomi DNS izolálására, míg néhány eljárás a plazmid DNS baktériumokból történő izolálására összpontosít. Ezért a két folyamatban levő lépések kissé különböznek egymástól. A teljes eljárás azonban mindkét izolációban azonos. Mindkét eljárás izolált DNS-jének óriási felhasználása van a későbbi folyamatokban, mint például a klónozás, a gélelektroforézis és a polimeráz láncreakciók. A genomiális DNS-izolációs protokoll végén a szervezet teljes genomiális DNS-ét izolálhatjuk végtermékként, míg a plazmid-DNS-izolációs protokoll végén az adott baktérium plazmid-DNS-ét izolálhatjuk végtermékként. Ezért ez a különbség a genomi DNS és a plazmid DNS izolálása között.

Referencia:

1. „DNS-extrakció Baktériumból” DNS kivonás baktériumokból. Itt érhető el 

Kép jóvoltából:

1. Joo Nath „DNS-extrakció” - Saját munkája (CC BY-SA 4.0) a Commons Wikimedia segítségével 
2. „Plasmid miniprep” Retama által - Saját munka, (CC BY-SA 4.0) a Commons Wikimedia segítségével