Különbség a genotípus és a szekvenálás között

Legfontosabb különbség - Genotípus és szekvenálás
 

A genotípus és a szekvenálás két módszer, amelyet a nukleinsavakkal, elsősorban egy szervezet DNS-ével kapcsolatos információk megszerzésére hajtanak végre. A genotípus és a szekvenálás közötti fő különbség az A genotipizálás annak meghatározása, hogy az egyén milyen genetikai variánsokkal rendelkezik markerek segítségével, míg a szekvenálás a nukleotidszekvencia helyes sorrendjének meghatározása az adott DNS-fragmensben.

TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a genotípus?
3. Mi a szekvenálás?
4. Side by side összehasonlítás - genotípus és szekvenálás
5. Összefoglalás

Mi a genotípus??

A genotípus meghatározása az egyén genetikai összetételének meghatározása egy DNS és marker szekvencia felhasználásával, valamint az öröklés összehasonlítása és azonosítása. A genotípus meghatározása fontos az evolúciós biológiában, a populációbiológiában, a taxonómiában, az ökológiában és a szervezetek genetikájában. Különböző technikákkal elvégezhető, beleértve a DNS-szekvenálást, a polimeráz-láncreakciót, a restrikciós fragmens hosszúságú polimorfizmust (RFLP), a véletlenszerűen amplifikált polimorf detektálást, az amplifikált fragmens hosszúságú polimorfizmust (AFLP), a DNS mikrotáblákat stb..

A genotípus meghatározása magában foglalja a DNS-szekvenciák bizonyos kis fragmentumainak szekvenálását és a genetikai összetétel rokonságának megismerését más egyénekkel genetikai markerek segítségével. Meghatározza az egyedi nukleotid polimorfizmusokat (SNP) az egyének vagy a specifikus allélek között. A genotípus meghatározása sokféle szervezetre alkalmazható, beleértve az embereket is. Alkalmazható mikroorganizmusokra is, például vírusokra, gombákra stb., És genetikai variánsaik referenciaprofilokkal történő meghatározására felhasználható. A molekuláris epidemiológiában és a kriminalisztikai mikrobiológiában a kórokozók, különösen a mikroorganizmusok ellenőrzése a genotipizálás során nyert információk alapján történik. A genotípus meghatározása nagyon fontos a származási elemzésben. Az embereket genotípussal erősítik meg az anyaság és az apaság. A genotípus feltárja a gének domináns és recesszív alléljait, amelyek meghatározzák a sajátosságokat.

Ábra: RFLP genotípuskészítés

Mi a szekvenálás??

A szekvenálás a nukleotid helyes sorrendjének meghatározása a DNS vagy RNS adott fragmentumában. A szervezet növekedéséhez és fejlődéséhez szükséges összes információ a genomjában van kódolva. A néhány száz nukleotid hosszú nukleinsavfragmensek előállítására és szétválasztására szolgáló technikák rendelkezésre állása olyan eljárások kifejlesztéséhez vezetett, amelyek lehetővé teszik egy adott DNS vagy RNS fragmens pontos nukleotidszekvenciájának meghatározását. Különböző típusú szekvenálási módszerek érhetők el ma. Ezek a szekvenálási módszerek, valamint a szervezet teljes genomját ábrázoló genomkönyvtárak felépítésének technológiái megkönnyítik a szervezet teljes genomjának szekvenálását, mélyreható elemzést végezve a génszerkezetekben, a génfunkciókban, a génhelyekben, a génexpressziókban, génképezés, génszabályozó régiók stb.

Számos vírus, számos baktérium, régészeti baktérium, élesztő és számos más organizmus teljes genomját szekvenáltuk és leképeztük. Az emberi genomprojekt lehetővé tette a teljes emberi genom szekvenálását és térképezését, valamint 2003. évi első tervezetének közzétételét. Ez jelentős mérföldkő a biológia fejlődésében. Az emberi genom szekvenciákat ma már az orvosi ágazatban használják a ritka betegségek genetikai okainak azonosítására, az újszülöttek betegség-kockázatának kiszűrésére, a különféle rákok genetikai részleteinek azonosítására, új gyógymódok kifejlesztésére és új diagnosztikai eszközök kidolgozására stb..

A növényvilágban a rizs genomját és az Arabidopsis genomját szekvenáltuk. Ezen szekvenciák ismerete kétségtelenül forradalmasítja a sejtek és az organizmusok működésének megértését.

Ábra: A Sanger szekvenálásának autoradiográfja

Mi a különbség a genotípus és a szekvenálás között??

Genotípus és szekvenálás
A genotípus meghatározása az egyén genetikai összetételének meghatározása és az adott szervezet csoportjának vagy taxonómiájának ellenőrzése.	A szekvenálás egy adott DNS vagy RNS fragmens nukleotidjainak pontos sorrendjének meghatározására szolgáló folyamat.
technikák
RFLP, génszekvenálás, PCR, DNS mikrotáblák, AFLP stb.	Sanger szekvenálás, Gilbert szekvenálás, pirosekvenálás, Next Generation szekvenálás, Shotgun szekvenálás stb..
Főbb aggodalmak
Ez inkább attól tart, hogy a genotípus különbségek adják-e a tényleges fenotípus különbségeket.	Ez jobban aggódik a nukleotidok rendje, különbségei és változásai mellett a többi szervezettel.

Összegzés - Genotípus és szekvenálás

A genotípus és a szekvenálás hasznos az organizmusok genetikai információinak tanulmányozására. A genotípus meghatározása az egyének közötti genotípus-változások meghatározásának és kategóriáinak megtalálásának folyamata. A szekvenálás a nukleotidok helyes sorrendjének meghatározása az érintett fragmensben vagy a DNS régiójában. Mindkét módszer fontos információkat szolgáltat a génekről és a genomokról.

Referencia:
1. „Genotípus-meghatározási módszerek”. Módszerek a molekuláris biológiában (Clifton, N. J.). Az Egyesült Államok Nemzeti Orvostudományi Könyvtára, n.d. Web. 2017. február 20.
2. Akey, J. M., Sosnoski D., Parra E., S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin és M. D. Shriver. "Az SNP-k olvadásgörbe elemzése (McSNP ): Gélmentes és olcsó megközelítés az SNP genotípusozásához." BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. háló.

Kép jóvoltából:
1. „RFLP genotipizálás” (ismeretlen) - Nemzeti Egészségügyi Intézetek (Public Domain) a Commons Wikimedia segítségével
2. Abiozar „Radioaktív fluoreszkáló” az angol Wikipédián (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével