Integrált proteinek vs perifériás proteinek
A fehérjéket makromolekuláknak tekintjük, amelyek egy vagy több polipeptidláncot tartalmaznak. A polipeptidláncok aminosavakból állnak, amelyek peptidkötésekkel kapcsolódnak egymáshoz. A fehérje primer szerkezetét az aminosav-szekvencia határozhatja meg. Bizonyos gének sok fehérjét kódolnak. Ezek a gének meghatározzák az aminosav szekvenciáját, ezáltal meghatározzák primer szerkezetüket. Az integrált és perifériás fehérjéket előfordulásuk miatt „plazmamembránfehérjéknek” tekintik. Ezek a fehérjék általában felelősek a sejtek azon képességéért, hogy kölcsönhatásba lépjenek a külső környezettel.
Integrált fehérje
Az integrált fehérjék elsősorban részben vagy egészben a plazmamembrán foszfolipidek kettős rétegében találhatók. Ezeknek a fehérjéknek mind poláris, mind nem poláris régiója van. A poláris fejek kinyúlnak a kettős réteg felületéből, miközben a nem poláros régiók be vannak ágyazva. Általában csak a nem poláris régiók lépnek kölcsönhatásba a plazmamembrán hidrofób magjával, hidrofób kötés kialakításával a foszfolipidek zsírsav farokával.
Azokat a beépített fehérjéket, amelyek az egész membránt a belső felületről a külső felületre terjesztik, transzmembrán proteineknek nevezzük. A transzmembrán fehérjékben mindkét vég, amely a lipidrétegből kinyúlik, poláris vagy hidrofil régió. A középső régiók nem polárosak, és felületükön hidrofób aminosavak vannak. Három típusú interakciók segítik a fehérjék beágyazását a lipid kettős rétegbe, nevezetesen az ionos kölcsönhatások a foszfolipid molekulák poláris fejeivel, a hidrofób kölcsönhatások a foszfolipid molekulák hidrofób farkával és a specifikus kölcsönhatások a lipidek, glikolipidek vagy oligoszacharidok bizonyos régióival..
Perifériás fehérje
A perifériás fehérjék (külső fehérjék) vannak a foszfolipidek kettős rétegének legbelső és legkülső részén. Ezek a fehérjék lazán kötődnek a plazmamembránhoz, vagy közvetlenül, a kétrétegű foszfolipidek poláris fejeivel való kölcsönhatás révén, vagy közvetett módon az integrált fehérjékkel történő kölcsönhatásokkal. Ezek a fehérjék az összes membránfehérje körülbelül 20-30% -át teszik ki.
A legtöbb perifériás fehérje a membrán legbelső felületén vagy citoplazmatikus felületén található. Ezeket a fehérjéket akár zsíros láncokat tartalmazó kovalens kötések, akár oligoszacharidok révén foszfolipidekké korlátozzák.
Mi a különbség az integrál és a perifériás fehérje között??
• A perifériás fehérjék a plazmamembrán felületén fordulnak elő, míg az integrált fehérjék részben vagy egészben merülnek fel a plazmamembrán lipidrétegében..
• A perifériás fehérjék lazán kötődnek a lipid kettős réteghez, és nem lépnek kölcsönhatásba a hidrofób maggal a foszfolipidek két rétege között. Ezzel szemben az integrált fehérjék szorosan kötődnek és közvetlenül kölcsönhatásba lépnek a plazmamembrán hidrofób magjával. Ezen okok miatt az integrált protein disszociáció nehezebb, mint a perifériás fehérjéknél.
• Az enyhe kezelések felhasználhatók a perifériás fehérjék izolálására a plazmamembránról, de az integrált fehérjék izolálásához az enyhe kezelések nem elegendőek. A hidrofób kötés megbontásához tisztítószerekre van szükség. Így az integrált fehérjék elkülöníthetők a plazmamembránból.
• E két fehérje plazmamembránból történő izolálása után a perifériás fehérjék semleges vizes pufferben oldhatók, míg az integrált fehérjék semleges semleges vizes pufferekben vagy aggregátumokban nem oldhatók fel.
• A perifériás fehérjékkel ellentétben, az integrált fehérjék szolubilizáláskor a lipiddel társulnak.
• Perifériás fehérjékre példaként említhetők az eritrociták spektruma, a citokróm C és a mitokondriumok ATP-ase-je, valamint az acetilkolinészteráz az elektro-relaxációs membránokban. Az integrált fehérjékre példa a membránnal határolt enzimek, a gyógyszer- és hormonreceptorok, az antigén és a rodopszin.
• Az integrált fehérjék körülbelül 70% -ot képviselnek, míg a perifériás fehérjék a plazmamembránfehérjék fennmaradó részét képviselik.