Különbség a motívum és a domain között

Az kulcs különbség a motívum és a domain között az, hogy a A motívum nem függetlenül stabil, míg a domén függetlenül stabil.

A fehérjék fontos biológiai makromolekulák a testünkben. Másrészt a gén genetikai kódja határozza meg a fehérje aminosav-szekvenciáját. Ezenkívül a fehérjék primer, szekunder és harmadlagos szerkezetűek. Az elsődleges szerkezet a polipeptidlánc aminosavszekvenciája. Amikor a polipeptid láncok összehajlanak, ez képezi a fehérje másodlagos szerkezetét. Az alfa-heliklikák, a béta-lemezek és a szuper-szekunder struktúrák a másodlagos szerkezetekhez tartoznak. A szuper-szekunder elemek bizonyos csoportjai protein motívumokként ismertek. A fehérje tercier struktúrája annak háromdimenziós szerkezetére utal, amely meghatározza a fehérje működését. A domén egy fehérjemolekula hajtogatott része, amely gömb alakú és diszkrét funkcióval rendelkezik. Ez a fehérje alapvető funkcionális és háromdimenziós szerkezete.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a motívum?
3. Mi a domain
4. A motívum és a domain hasonlóságai
5. Összehasonlítás egymással - Motívum vs domain táblázatos formában
6. Összegzés

Mi az a motívum??

A motívum a fehérjék szuper szekunder elemeinek bizonyos csoportja, például az alfa-heliklikák és a béta-struktúrák. Valamilyen minták, amelyek a különböző fehérjékben vannak jelen. A motívumok leírják a szekunder szerkezeti elemek hajtogatási mintáit és azok kölcsönhatásait. Ezek a hajtogatási minták hasonló kötésekkel stabilizálódnak, amelyek a tercier struktúrákban vannak jelen. Ezek azonban nem annyira összetettek, mint a harmadlagos struktúrák.

01. ábra: Motívum

Ezek a fehérjék másodlagos szerkezetének egyszerű kombinációi. A motívum önmagában nem stabil. Ezenkívül a motívumok magyarázzák a fehérje szerkezetét, de nem jósolják meg a fehérje működését. Például a fehérjemintákra egy béta-alfa-béta motívum, görög kulcsfontosságú motívum, béta hordó, béta-meander motívum stb..

Mi az a domain??

A domén egy fehérje alapvető, funkcionális és háromdimenziós egység. Egy bizonyos funkciót hajt végre. Egyetlen fehérjenek több különálló doménje lehet. Minden domain független egység. Ez egy globális szerkezet. Felelős egy adott funkcióért vagy interakcióért. A domének felhasználhatók egy nem jellemzett fehérje funkciójának feltételezésére. A fehérje elemzésekor elengedhetetlen figyelembe venni, mivel a domének a fehérje funkcionális egységei.

22. ábra: A piruvát-kináz három különböző területe

A domain nagy stabil és kompakt szerkezetű. Könnyen megkülönböztethetők más régióktól. A piruvát-kináznak három megkülönböztető doménje van, amint azt a 02. ábra mutatja. A domén hossza változhat, és az átlagos hossza 100 aminosav. Mindegyik domén tartalmaz egy szekunder szerkezeti egységekből épített hidrofób magot. Több domén együttesen alkotja a fehérje tercier szerkezetét.

Milyen hasonlóságok vannak a motívum és a domain között??

• A motívum és a domén egységek, amelyek magukban a fehérjemolekulákban vannak jelen.
• Hasznosak a fehérjecsaládok osztályozásában.

Mi a különbség a motívum és a domain között??

A motívum a fehérjék szuper szekunder elemeinek bizonyos csoportja, például az alfa-heliklikák és a béta-struktúrák, míg a domén a fehérje funkcionális egysége. Ezenkívül a motívum egy másodlagos szerkezet, míg a domén felelős a fehérje tercier struktúrájáért. Sőt, a domain független egység, a motívumtól eltérően. Ezenkívül a domén egy fehérje funkcióját ábrázolja, míg a motívum nem. Ezek a fő különbségek a motívum és a domain között. Az alábbi infographic bemutatja a motívum és a tartomány közötti különbséget táblázatos formában.

Összegzés - Motívum vs domain

A motívum a fehérje molekula másodlagos szerkezeteinek elrendezése. Önmagában általában nem stabil, ellentétben a domainkel. A domén egy fehérje függetlenül stabil szerkezete. Ezért lehet egy részleges vagy teljes fehérje molekula. Ez a fehérje háromdimenziós alapvető funkcionális egysége. Sőt, van funkciója, és független egység. A motívum a domain része lehet. A domain azonban nem lehet motívum része. Ez a különbség a motívum és a domain között.

Referencia:

1. „Fehérje domén”. Wikipedia, Wikimedia Alapítvány, 2018. július 31

Kép jóvoltából:

1. „Anthrax toxin protein motívum” NatelewisDerivatív munka (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. „Piruvát-kináz-protein domének”: Thomas Splettstoesser - Saját munka, (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia-on keresztül