Különbség a célzott és a nem célzott proteomika között

A fő különbség a célzott és a nem célzott proteomika között az, hogy A célzott proteomika célja egy specifikus fehérje mennyiségének mérése, míg a nem célzott proteomika nem a specifikus fehérjét célozza.

A proteomika a fehérjék, szerkezeteik és funkcióik nagyszabású vizsgálata. A sejtekben, szövetekben vagy szervezetekben a teljes fehérjekomplementumot vizsgálja meghatározott körülmények között. Kétféle proteomika létezik: célzott proteomika és nem célzott proteomika.

TARTALOM

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a célzott proteomika?
3. Mi a nem célzott proteomika?
4. A célzott és a nem célzott proteom hasonlóságai
5. Összehasonlítás egymással - Célzott és nem célzott proteomika táblázatos formában
6. Összegzés

Mi a célzott proteomika??

Amint a neve is jelzi, a célzott proteomika egy specifikus fehérjét vagy egy peptidöt céloz meg a fehérjék komplex keverékében elemzés céljából. Ezután megvizsgálja az előre kiválasztott specifikus protein jelenlétét és mennyiségét. Ez a módszer csak egy mintára vagy több mintára lehetséges. Ez a módszer alkalmas még egy specifikus fehérjecsoportra is. Pontosabb, mennyiségi és érzékeny adatokat eredményez. Ezenkívül a tömegspektrometria és a célzott proteomika együttesen pontosabb és megbízhatóbb méréseket eredményez. Ez a módszer hármas kvadrupol tömegspektrométert (QQQ) használ az elemzéséhez.

01. ábra: Proteomika

A célzott proteomika egy megfelelő módszer, ha ellenőrizni akarja, hogy valóban leütötték-e a leütési célt, vagy ha mennyiségileg meg kívánja határozni egy adott fehérjét / peptidet a vér szérumában, agyi folyadékban vagy a sejtlizátumban stb. annak ellenőrzése, hogy egy adott fehérje expresszálódik-e differenciálisan a mintákban vagy egy időbeli kísérlet során.

Mi az a nem célzott proteomika??

A nem célzott proteomika, amint azt a neve is megemlíti, nem célozza meg egy specifikus fehérjét vagy peptidet elemzése céljából. Discovery proteomika egy másik név a nem célzott proteomika számára. Valójában egy „globális” elemzésről van szó. Általában a nem célzott proteomika elvégzése a következő kérdés megválaszolása: „mely fehérje vagy fehérjék vannak ebben a mintában vagy több mintában?”. Ez a módszer nem érzékeny, mint célzott proteomika. De számos fehérjét képes azonosítani és mérni, beleértve az új fehérjéket is. A nem célzott proteomika kvantitatív és kvalitatív méréseket is eredményezhet.

Milyen hasonlóságok vannak a célzott és a nem célzott proteomika között??

• Mind a megcélzott, mind a nem célzott proteomikák mérik a fehérjéket a mintában.
• Fontosak a proteom elemzésben.
• Ezek a módszerek tömegspektrometriát használnak.

Mi a különbség a célzott és a nem célzott proteomika között??

Először, a célzott proteomika egy adott fehérje vagy peptid jelenlétének és mennyiségének meghatározása a fehérjék komplex keverékében. Ezzel szemben a nem célzott proteomika a mintában vagy mintákban lévő fehérjék mennyiségi és minőségi vizsgálata anélkül, hogy egy adott fehérjét megcéloznának. A célzott proteomikát előre kiválasztott vagy célzott fehérjékkel hajtjuk végre, míg a nem célzott proteomikát a mintában levő proteinek típusainak megismerése céljából végezzük. Sőt, a célzott proteomika érzékenyebb, mint a nem célzott proteomika.

Összegzés - Célzott vs Nem célzott proteomika

Összegezve: a célzott és nem célzott proteomika kétféle protein tanulmány. Amint a nevük sugallja, a célzott proteomika egy meghatározott fehérjét céloz meg, míg a nem célzott proteomika nem egy specifikus fehérjét céloz meg. Ez a különbség a célzott és a nem célzott proteomika között.

Referencia:

1. „Célzott proteomika”. UC Davis Proteomics Core, elérhető itt.
2. „Proteomika / Bevezetés a proteomikába.” Zeneelmélet / módok - Wikikönyvek, Nyílt könyvek a nyitott világért, elérhető itt.

Kép jóvoltából:

1. „Proteomics” az Xxl7441 által az angol Wikibooks-on - átváltva az en.wikibooks-ról a Commons-ba (Public Domain) a Commons Wikimedia-on keresztül