A DNS-klónozás fontos folyamat, amely lehetővé teszi az organizmusok fontos DNS-fragmentumainak szaporítását. Szükség van egy specifikus DNS és a vektor DNS összekapcsolására rekombináns DNS létrehozása céljából, amely transzformálódik a gazdaszervezetbe. A vektor olyan DNS-molekula, amely hordozóként viselkedik, hogy idegen genetikai anyagot szállítson egy másik sejtbe vagy szervezetbe. Képesnek lennie arra, hogy replikálódjon a gazdaszervezet belsejében, és több példányban előállítsa a rekombináns DNS-t. Különböző típusú vektorok vannak a DNS-klónozásban. Az élesztő mesterséges kromoszóma (YAC) és az M13 fágvektor két típusa. A fő különbség az YAC és az M13 fágvektor között az A YAC egy mesterséges kromoszóma, amely replikálódik az élesztősejtekben míg Az M13 fágvektor az M13 bakteriofág egyszálú, kör alakú DNS-je, amely a benne replikálódik E Coli sejteket.
TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi az a YAC?
3. Mi az M13 Phage Vector?
4. Összehasonlítás egymással - YAC vs M13 Phage Vector
5. Összegzés
Az YAC egy mesterségesen felépített kromoszóma, amely képes idegen DNS nagy részét hordozni és replikálódni az élesztősejtekben. Centromer, telomer és autonóm módon replikáló szekvenciákkal rendelkezik, amelyek nélkülözhetetlenek a replikációhoz és a stabilitáshoz. Az YAC-nak szelektív markert vagy markereket és restrikciós helyeket is tartalmaznia kell, hogy ez hatékony klónozási vektor legyen. Az 1000 és 2000 kb közötti nagy szekvenciákat be lehet illeszteni az YAC-ba és átvinni az élesztőbe.
01. ábra: YAC vektor
Az M13 bakteriofág egy vírus, amely megfertőzi és szaporodik benne E Coli. Az M13 bakteriofág genomja kicsi, körülbelül 6,7 kb. Ez egyszálú, kör alakú és pozitív érzékű DNS. Ez a vírus kifejezetten megfertőzi E Coli baktériumok az F pálcán keresztül. Miután belépett az ssDNS-be a baktériumba, szintetizálja a komplementer szálat és dsDNS-nek vagy az M13 replikációs formájává (RF) válik. Az RF úgy viselkedik, mint egy plazmid a gazdaszervezetben. A dsDNA replikálódik belül E Coli és új fágokat hordozó ssDNS-t állít elő. Ezek az új fágok folyamatosan felszabadulnak a E Coli anélkül, hogy megölnénk a gazdasejtet. A fertőzés azonban lelassítja az E Coli növekedését. A dsDNS kivonható baktériumsejtekből és felhasználható vektorként a DNS klónozásában. M13 fágvektorokként ismertek. Könnyen manipulálhatók és felhasználhatók a plazmidvektorokhoz hasonlóan.
Ezeknek az M13-fágoknak a bennük rejlő fertőzőképessége jó tulajdonságot jelent arra, hogy vektorként használják a génklónozást. Amikor az M13-at vektorré alakítja, több elemet be kell építeni a genomba. Ezek a lac represszor (lac I) fehérje génjei, az operátor proximális régiója lac Z gén, lac promoter és többszörös klónozási hely (polilinker). Ha vektorként használják az M13 dsDNS-ét, plazmidvektorként kezelhető. Az ssDNA M13 alkalmazásának azonban előnyei vannak a DNS-szekvenálásban és a helyspecifikus mutagenezisben.
Mivel az M13 fágvektor több klónozási helyet hordoz lacZ régióban a rekombinált vektorok könnyen azonosíthatók az IPTG-t és X-Gal-t tartalmazó agarlemezeken végzett kék / fehér kolónia szkrínelésével. A lemezeken előállított kék plakkok nem tartalmazzák a rekombinált fágokat. Ezért a beszúrásos fágok kiválaszthatók a klónozás céljából.
02 ábra: M13 bakteriofág
YAC vs M13 fág vektor | |
A YAC egy genetikailag módosított kromoszóma, amely képes idegen DNS nagy részét hordozni és replikálódni az élesztősejtekben. | Az M13 fágvektor az M13 bakteriofág által kifejlesztett vírusvektor, amelyet idegen DNS beillesztésére használnak E Coli. |
Célja | |
Az YAC-kat úgy tervezték, hogy a genomi DNS nagy fragmentumait élesztőbe klónozzák. | Az M13 fágvektorokat idegen DNS beillesztésére használják E Coli. |
Beszúrás hossza | |
Az YAC-k tartalmazhatnak megabázis méretű genomi betéteket (1000 kb - 2000 kb). | A betétek mérete körülbelül 1500 bps. |
Építkezés | |
A YAC-DNS-t intakt tisztítani nehéz, ezért magas koncentrációra van szükség az YAC-vektorrendszer előállításához. | Ez ciklikus fotoszintetikus elektronláncon keresztül történik. |
Stabilitás | |
A YAC instabil. | Az M13 fágok könnyen kivonhatók. |
Méret | |
Az enzimek nagyobb molekulák. | Az M13 fágok stabilak, mint a YAC. |
Az YAC egy mesterségesen előállított vektorrendszer, amely az élesztő kromoszóma egy meghatározott régióját használja a genetikai anyag nagy szegmenseinek az élesztősejtekbe történő beillesztésére. Az M13 fágvektor az M 13 bakteriofágból származó vektorrendszer, amely felhasználja E coli mint gazdaszervezet. Ez a fő különbség a YAC és az M13 Phage Vector között. Mindkettő egyaránt hasznos a rekombináns DNS technológiában és a génklónozásban.
Referencia:
1.”Vector„. Genetikai jegyzetek - vektor. N.p., n.d. Web. 2017. május 16. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Élesztő mesterséges kromoszóma." Wikipedia. Wikimedia Alapítvány, 2017. április 21. Web. 2017. május 16. .
Kép jóvoltából:
1. „M13B” J3D3-val - Saját munka (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével