Az agytörzs egy jól szervezett közbenső szerkezet, amely funkcionálisan összeköti az agykéreg és a gerincvelő. Az egész agy mindössze 2,5% -át teszi ki, de fontos funkciót tölt be, amely az emberi túléléshez szükséges. Alapvető életfunkciói a légzés, a vérnyomás és a pulzus szabályozása. Ez is a rendszer része, amely felelős a tudatosságért. Ez az érzékszervi és motoros idegrostok átjárója, amelyek a test különböző részeit beindítják. Három struktúrából áll, nevezetesen az agy középső részéből, a pontokból és a medullaból. A középső agyat a felső agytávnak nevezik. A pontok és a medulla alkotják az alsó agyt. Fontos érzékszervi, motoros és vegyes idegeket okoz az agytörzs, amely végül kilép a koponán keresztül, hogy elérje a célszervét.
A Pons a latin nyelvből származik, ami szó szerint „híd”. Számos idegi-vezető szálat tartalmaz, amelyek hosszirányban, keresztirányban és hátra vannak irányítva, hogy idegi impulzusokat továbbítsanak a környező struktúrákba. A pontok a középső agy és a medulla oblongata között helyezkednek el. Mögötte a kisagy. Nyersen jellemzi két hagymás szerkezet, az úgynevezett felső és középső kisagycsont. Ezek a lábak az agytörzs pont pontját a kisagyhoz kötik, ami egy idegi szerkezet, amely a normális járáshoz és egyensúlyhoz szükséges.
Négy fontos koponya ideg a pontokból, nevezetesen a vestibulocochleáris idegből (8. koponya ideg), az arcidegből (7. koponya ideg), az abducens idegből (a 6. koponya idegből) és a hármas idegből (5. koponya idegből). A vestibulocochlearis idegek impulzusokat továbbítanak a fülbe hallásfunkció céljából. Az egyensúlyérzet megszerzéséhez is fontos. A pontok tartalmaznak egy neurális struktúrát is, az úgynevezett „olivary komplex”, amely lehetővé teszi a hang helymeghatározását és a zaj csökkentését. Ez egy speciális idegi szerkezet a halláshoz. Az arcideg motoros impulzusokat küld az arcizmokhoz, ami lehetővé teszi az emberek számára az arckifejezések megjelenését. Ezenkívül ízérzetet biztosít a nyelv elülső kétharmadának, megkönnyíti a könnyeződést és a szájizálódást. Az abducens ideg irányítja a szem izomját, amely felelős oldalra nézésért. A hármas ideg az érzékszervi funkciókat továbbítja az arcra. A rágást lehetővé tevő izmok motoros funkcióját is biztosítja.
A medulla oblongata az agytörzs legalacsonyabb része. A foramen magnum szintjén helyezkedik el, amely a koponya hátsó nyílása. Összességében úgy néz ki, mint a gerincvelő legfelső részének finom nagyítása, 1 cm átmérőjű és 2,5 cm hosszú. Két különálló emelkedés jellemzi. Az első kiemelkedő szerkezetet medullaáris piramisoknak nevezik. Ezek olyan neurális rostok, amelyek motoros funkciót látnak el, és az agykéregből a gerincvelőbe ereszkednek le. Érdekes módon az agytörzsben ezek az idegi szálak a másik oldalra keresztezik a medulla oblongata szintjén. Ennélfogva a medullaáris piramisokat piramis deszkuszálásnak is nevezik. Ennek fontos klinikai következményei vannak, mivel elmagyarázza, miért jelentkezik az agyfélteke jobb oldalán lévő stroke a test bal oldalának gyengeségével vagy bénulásával. Összességében egy másik kiemelkedő dudor az alsóbbrendű olajmag, amely összeköti a medulát a kisagyval.
A pontokkal ellentétben, a medulából kilépő koponya idegek a glossopharyngeal ideg (9. koponya ideg), vagus ideg (10. koponya ideg), gerinc kiegészítő ideg (11. koponya ideg) és hypoglossal ideg (12. koponya ideg). A glossopharyngeális ideg úgy működik, hogy ízérzetet biztosítson a nyelv hátoldalán, és aktiválja a garat izmait a nyelés elősegítése érdekében. A vagus ideg egy autonóm ideg, amelynek a leghosszabb útja van. A garatból egészen a vastagbél lép-hajlásáig terjed. Segít aktiválni az izmokat a nyelés és a fonálás szempontjából. Ez lehetővé teszi a mellkas és a hasi szervek normál működését. A hüvelyideg felelõs a gag reflexért is, amelyet a nyelv hátsó részének vagy a garat falának megsimogatásával lehet kiváltani. A gerinc kiegészítő idege további idegi szálakat szolgáltat a vagus ideghez. Segít a fej elfordításában és a vállak vállat vonásában, a megfelelő izmok aktiválásával. A hypoglossal ideg megkönnyíti a nyelést azáltal, hogy lehetővé teszi a nyelv önkéntes mozgását. A motoros idegek, amelyek beindítják a létfontosságú szerveket, a medulla oblongata-ból származnak. Példa erre a kardiovaszkuláris központ, amely felelős a szívizom összehúzódásáért, lehetővé téve számunkra, hogy stabil vérnyomása és pulzusa legyen. Az érrendszeri központ az érfalak kiszélesedésének szabályozására szolgál. A légzőközpont felelős a légzés számos szempontjának, például a mélységnek, a sebességnek és a ritmusnak a szabályozásáért, a medulla területén is. A hányást, köhögést, tüsszentést, nyelést és csuklást közvetítő egyéb reflexközpontok szintén átjutnak a medullaon.
Az alsó agytörzs részeként mind a pons, mind a medulla oblongata fontos idegi struktúrák, megkülönböztetett anatómiai jellemzőkkel és élettani funkciókkal. A pontok jobbra helyezkednek el, közvetlenül a medulla felett. Idegeket tartalmaz, amelyek fontosak a halláshoz, az egyensúlyhoz, az arcizmok mozgatásához, rágáshoz és oldalra nézéshez. A medulla alsóbbrendű, közvetlenül a gerincvelő felett helyezkedik el. Idegi struktúrákat tartalmaz, amelyek nélkülözhetetlenek az emberi élet fenntartásához. Megkönnyíti a nyelést, a beszédet, a fej elforgatását és a vállak vállat vállát.