Okazaki Fragments vs Lagging Strand
Az „Okazaki-fragmensek” és a „lemaradó szál” kifejezéseket gyakran használják a kémiában. Valószínűleg sokat hallott az okazaki-fragmentumokról és a késő szálról a kémia osztályban. Nos, csak akkor, ha figyelmesen hallgatod professzorát. Ez a cikk frissítőként szolgál arra, hogy mi az okazaki-töredékek és a lemaradó szál.
Az Okazaki fragmentumokat és a lemaradó szálat addig tárgyaljuk, amíg a DNS replikációt nem vesszük figyelembe. Mindenekelőtt a DNS replikációját annak a biológiai folyamatnak kell meghatározni, amely minden élő szervezetben megtörténik, és másolja a DNS-ét. A DNS viszont a biológiai öröklés alapja.
A DNS replikációja során okazaki fragmentumok képződnek. Ezek az okazaki-töredékek viszonylag rövidek. Ezeket végtermékeknek vagy újonnan szintetizált DNS-fragmentumoknak tekintik, amelyek a lemaradó szálon képződnek. Egyszerűen fogalmazva: az okazaki-fragmensek a lemaradó szálon alakulnak ki. A lemaradó szálat úgy definiáljuk, mint a DNS-szálat, amely folyamatosan replikálódik az öt láb és a három láb irányába. Az öt láb és három láb közötti irány a molekuláris biológia irányultsága.
Az Okazaki-fragmensek kiegészítik a lemaradt szálat. Ezek nélkül nem alakulnak ki rövid, kétszálú DNS-szakaszok. Ha meg akarjuk határozni az okazaki-fragmensek hosszát, akkor azok 1000–2000 nukleotid hosszúságúak Escherichia coli-ban, egyfajta baktérium, mely általában megtalálható a melegvérű organizmusok béljében. Az Okazaki fragmensek 100-200 nukleotid hosszúságúak az eukariótákban, amelyek bonyolult sejtszerkezetű szervezetek.
Az okazaki-fragmenseket RNS-primerek választják el. És ha az RNS primereket eltávolítják, akkor a ligázzal elnevezett enzim összekapcsolja az okazaki fragmentumokat, hogy újonnan szintetizált komplementer szálat képezzenek.
Mint korábban már említettük, az okazaki-fragmensek és a lemaradó szál egymást kiegészítik. Van azonban egy másik DNS-szál, amely nagyon fontos szerepet játszik a DNS-replikációs folyamat során. Ezt nevezik a vezető szálnak. Ha a lemaradó szálat úgy definiálják, hogy azt megszakíthatatlanul megismételik, akkor a vezető szál fordítva fordul. Folyamatosan megismételik. A vezető szál jelenléte lehetővé teszi a szülő kettős szálú DNS letekeredését. Egyszerűen fogalmazva: a vezető szál által kínált út folyamatos.
A DNS replikációja során a szálakat öt-három láb irányba kell kötni. A vezető szál zavartalan vagy folyamatos útja esetén nem lesznek problémák. De amikor a lemaradó szálról van szó, mivel a DNS antiparallel irányára vonatkozik, akkor nem lehet folyamatos. A kompenzáció érdekében a lemaradó szálakat rövid szálak formájában állítják elő, az okazaki-fragmensek kiegészítő segítségévei. Meglehetősen normális, ha a DNS-szálak ellentétes irányban futnak, mivel a DNS szerkezete kettős spirál. Mivel a lemaradó szál anti-párhuzamos irányban van, polimerázja úgy működik, hogy visszatér a replikációs villa felé és apró darabokra.
Kiwako Sakabe és Reiji Okazaki 1966-ban fedezte fel az okazaki-fragmentumokat és a DNS-replikációs folyamat többi kapcsolódó folyamatát. Kutatást végeztek az Escherichia coli baktérium DNS-replikációs folyamatával kapcsolatban..
Összefoglaló: