A kromoszóma séta és az ugrás közötti különbség

Legfontosabb különbség - Séta a kromoszóma és az ugrás között
 

A kromoszómás járás és a kromoszóma ugrás két olyan technikai eszköz, amelyet a molekuláris biológiában használnak a géneknek a kromoszómákon történő meghatározására és a genomok fizikai feltérképezésére. A kromoszómás séta egy célgén klónozására szolgáló módszer egy genomi könyvtárban, a genomi könyvtár szomszédos klónjainak ismételt izolálása és klónozása révén. A kromoszómális ugrás a kromoszómás séta különleges változata, amely legyőzi a kromoszómális séta törési pontjait. A kromoszómás járás csak a kromoszómák kis hosszúságát képes szekvenálni és leképezni, míg a kromoszómális ugrás lehetővé teszi a kromoszómák nagy részeinek szekvenálását. Ez a legfontosabb különbség a kromoszómális járás és a kromoszómális ugrás között.

TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a kromoszóma járás?
3. Mi a kromoszómaugrás?
4. Összegzés egymással - kromoszóma séta vs ugrás
5. Összegzés

Mi a kromoszóma séta??

A kromoszómás járás olyan eszköz, amely feltárja a kromoszómák ismeretlen szekvencia régióit egymással átfedő restrikciós fragmentumok felhasználásával. A kromoszómás járás során az ismert gén egy részét használjuk próbaként, és folytatjuk a térképezendő vagy szekvenálandó kromoszóma teljes hosszának jellemzésével. Ez a jelzőtől a célhosszig megy. A kromoszómás járás során az egyes átfedő fragmensek végeit hibridizációra használjuk a következő szekvencia azonosítására.

A próbákat a klónozott DNS végdarabjaiból készítjük és szubklónozzuk. Ezután felhasználják a következő átfedő rész megtalálására. Mindezeket az átfedő szekvenciákat használjuk a kromoszóma genetikai térképének elkészítésére és a célgének lokalizálására. Ez egy módszer a hosszú DNS-szakaszok elemzésére a rekonstruált genomkönyvtárból származó, egymással átfedő fragmensek segítségével.

Kromoszómás járástechnika - lépések

1. Az ismert gént vagy markert tartalmazó DNS-fragmentum izolálása a célgén közelében

2. A kiválasztott fragmens restrikciós térképének elkészítése és a fragmens végrégiójának szubklónozása próbaként való felhasználás céljából
3. A próba hibridizációja a következő átfedő fragmenssel
4. Az 1. fragmens restrikciós térképének elkészítése és az 1. fragmens végrégiójának szubklónozása próbaként történő felhasználásra a következő átfedő fragmentum azonosításához.
5. A próba hibridizációja a következő átfedő 2. fragmenssel

6. A 2. fragmens restrikciós térképének elkészítése és a 2. fragmens végrégiójának szubklónozása próbaként a következő átfedő fragmens azonosításához

A fenti lépéseket a célgénig vagy a szekvencia teljes hosszának 3'-végéig kell folytatni.

01. ábra: Kromoszómás járástechnika

A kromoszómás járás fontos szempont a citogenetikában sok organizmus SNP-jének megtalálásában, a genetikai úton terjedő betegségek elemzésében és a releváns gének mutációinak megtalálásában.

Mi a kromoszómaugrás??

A kromoszómális ugrás egy olyan módszer, amelyet a molekuláris biológiában használnak az organizmusok genomjainak fizikai feltérképezésére. Ezt a technikát a kromoszómás járás akadályának leküzdésére vezetik be, amely a klónozási folyamat során az ismétlődő DNS-régiók megtalálásakor keletkezett. Ezért a kromoszómaugrásos technikát a kromoszómás járás speciális változatának tekinthetjük. Ez egy gyors módszer, összehasonlítva a kromoszómás járással, és lehetővé teszi az ismétlődő DNS-szekvenciák megkerülését, amelyek nem hajlamosak klónozni a kromoszómális járás során. A kromoszómális ugrás szűkíti a távolságot a célgén és a genom térképezéséhez rendelkezésre álló ismert markerek között.

A kromoszómaugrató eszköz egy specifikus DNS kivágásával kezdődik, speciális restrikciós endonukleázokkal, és a fragmensek körözött hurkokba kapcsolásával. Ezután egy ismert szekvenciából tervezett alapozót használunk a kör alakú hurkok szekvenálására. Ez a primer alternatív módon lehetővé teszi az ugrást és a szekvenálást. Ezért képes megkerülni az ismétlődő DNS-szekvenciákat, és gyorsan áthaladhat a kromoszómán a célgén keresése érdekében.

A cisztás fibrózis betegséget kódoló gén felfedezését a kromoszómális ugró eszköz segítségével végeztük. A kromoszómális ugrás és a járás együttesen javíthatja a genom térképezési folyamatát.

02 ábra: Kromoszóma ugrás

Mi a különbség a kromoszóma séta és az ugrás között??

Kromoszóma séta vs ugrás
A kromoszóma egy eszköz, amelyet a molekuláris biológiában használnak a genom térképezéséhez és meghatározott gének lokalizálásához.	A kromoszómaugrás olyan eszköz, amelyet a genomok fizikai feltérképezéséhez és a célgének gyors megtalálásához használnak a kromoszómákban.
A szekvenálás összehasonlító hossza
Csak kis fragmentumokat lehet klónozni a kromoszómás járással.	A kromoszómák nagyobb hosszúságát a kromoszóma ugrás segítségével térképezhetjük fel.
Ismétlődő DNS klónozása a kromoszómákban
A kromoszómás járástechnika nehezen képes átjárni a kromoszómákban található ismétlődő DNS-szekvenciákat.	Lehetővé teszi az ismétlődő DNS-szekvenciák megkerülését. Ezért nincs nehézség a szekvenálás során.
A folyamatokat befolyásoló tényezők
A folyamat sikere függ a genom méretétől és attól a távolságtól, amelyet az ismert genomiális pozíciótól a kívánt gén felé kell „megtenni”..	A siker nem függ a marker és a cél közötti távolság genomjának méretétől.
A nem klónozott DNS hatásai
A kromoszomális járást klónozott DNS-fragmensekkel meg lehet állítani.	A legalacsonyabb hangjegyű pikkolók D lehet4.
Ismert szekvencia szükségessége
A folyamat egy ismert génnel kezdődik a cél közelében.	A folyamathoz egy ismert fragmentum szükséges az alapozó tervezéséhez.

Összegzés - Séta a kromoszóma vs ugrás

A kromoszómás sétálást gyakran alkalmazzák, amikor ismert, hogy egy adott gén a kromoszómában egy korábban klónozott gén közelében található, és ez azonosítható a szomszédos genomi klónok ismételt izolálásával a genomi könyvtárból. Ha azonban a kromoszómás járás során ismétlődő DNS-régiókat találunk, akkor a folyamat nem folytatható. Ezért a technika ettől a ponttól megszakad. A kromoszómális ugrás egy molekuláris biológiai eszköz, amely leküzdi ezt a korlátot a genomok feltérképezéséhez. Megkerüli ezeket az ismétlődő DNS-régiókat, amelyeket nehéz klónozni, és segít a genomok fizikai feltérképezésében. Ez a fő különbség a kromoszóma séta és az ugrás között.

Irodalom:
1. Nakaseko, Jukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa és Mitsuhiro Yanagida. "A kromoszómás séta erősen homológ ismétlődő szekvenciát mutat a hasadó élesztő összes centromer régiójában." Az EMBO Journal. Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Orvostudományi Könyvtára, 1986. május. Web. 2017. március 22
2. Taheri, Ali. - Kromoszóma séta és ugrás. A géntechnika fejlesztése. OMICS International, 2013. október 30. Web. 2017. március 22