Különbség a klón klónszekvenálás és a pisztoly szekvenálás között

Az kulcs különbség A klón klónszekvenálás és a lövöldözős szekvenálás között a viselkedésük módja rejlik. A klón klón szekvenálási módszerrel a kromoszómák feltérképezését és a szekvenálás előtti klónozást folytatjuk, míg a klón szekvenciával történő klónozása a szekvenálás során mind a kromoszóma feltérképezését, mind a klónozási lépéseket kihagyja.

A klón szekvenálás és a klón szekvenálás révén a modern genom szekvenálás két módszere. A klón klón szekvenálásával a szekvenálás megbízhatóbb módszer. A pisztoly szekvenálással végzett klónozási módszer azonban gyorsabb és olcsóbb. A cikk a klónok szekvenálás és a fegyverszekvenálás közötti finom különbségre összpontosít.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a klón a klónok szekvenálásával? 
3. Mi a klón a lövöldözős sorrendben?
4. hasonlóságok a klónok klónszekvenálás és a pisztolyszekvenálás között
5. Side by side összehasonlítás - Klón klón szekvenálás vs lőfegyver szekvenálás táblázatos formában
6. Összegzés

Mi az a klón a klónok szekvenálásával??

A klón klón szekvenálásával a genom szekvenálás módszere. A DNS megosztása előtt megköveteli az egyes kromoszómák feltérképezését. A feltérképezés után a DNS-t 150 kilobázis hosszú fragmentumokra kell bontani. Ezek a fragmensek ezután készen állnak a szekvenálásra. A következő lépés a DNS-fragmensek beillesztése a bakteriális mesterséges kromoszómákba (BAC), majd a baktériumsejtekbe. Mivel a fragmensek ma már a baktériumsejtekben vannak, a baktériumok minden egyes megosztásakor a beillesztett DNS-fragmensek is osztódnak és sok azonos másolatot állítanak elő. Ezután az egyes baktériumklón-DNS-t 500 bázispár hosszú fragmentumokká fragmentáljuk. Kisebbek és egymást átfedő töredékek. Ezután a szekvenálást úgy végezzük, hogy ezeket a fragmentumokat beillesztjük egy ismert DNS-szekvenciájú vektorba. A vektor ismert szekvenciájától kezdve a szekvenálás ismeretlen szekvenciáig folytatódik.

A szekvenálás befejezése után meg kell határozni az átfedő szekvenciák területeit. Ezt követően a fragmensek összekapcsolása megtörténik a nagyobb fragmentumok kialakítása céljából, amelyeket eredetileg a BAC-k tartalmaznak. Ezután a nagyobb fragmenseknek a kromoszómába történő összeszerelését a genomtérkép szerint végezzük.

01. ábra: Klón klón szekvenálás segítségével

A klón jelentős előnye a klónszekvenálás révén az, hogy az előre elkészített genomtérkép elősegíti a nagyobb fragmentumok megbízható összeállítását. Ennek a szekvenálási módszernek az a hátránya, hogy időigényes a genomtérképek és a klónok előállítása. Ezt a módszert részesítették előnyben az „Emberi Genom Projekt” során..

Mi az a klón Shotgun szekvenálással??

A pisztolyos klónos szekvenálás egy olyan szekvenálási módszer, amely véletlenszerűen feldarabolja a DNS-szekvenciákat sok kis fragmentumra, és újra összeállítja a szekvenciát az átfedő régiók megfigyelésével. A nagyobb emlős genomokat nehéz klónozni és összeállítani. Ennek oka szerkezeti összetettségük és méretük. Annak ellenére, hogy a klón klónszekvenálási módszerrel megbízható, hosszú időbe telik a komplex szervezetek genomjainak szekvenálása. Ezért a klónon keresztüli szekvenálás megbízható, olcsóbb szekvenálási módszerré vált, amely gyorsabban végrehajtható. Ezért a mai tudósok erre a szekvenálási módszerre támaszkodnak az összetett genomok kezelésére.

02 ábra: Klón a lövészfegyver szekvenálásával

A lőfegyver-szekvenálási módszerrel végzett klón során nem történik hagyományos genom-feltérképezési és klónozási lépés. Kezdetben a teljes genom különböző méretűre oszlik, 20 kilobázis és 300 kilobázis között. Ezután sor kerül a szekvenálásra. Ezután kifinomult számítógépes szoftverek segítségével össze kell szerelni a fragmentumokat az átfedő régiók nézésével.

Lőfegyverrel végzett klónozás segít javítani a meglévő genomszekvenciák pontosságát. Ennek a módszernek az a fő előnye, hogy sokkal gyorsabb és olcsóbb, mint a klónos szekvenálási módszer. Ez a folyamat azonban nem foglalja magában genetikai térkép használatát. Ezért a szerelés során hibák előfordulása valószínűbb. Ez tehát a pisztoly szekvenálási módszerrel végzett klón egyik fő hátránya.

Milyen hasonlóságok vannak a klónok a klónszekvenálás és a puska szekvenálás között??

• Mind a klón szekvenálással, mind a lőfegyver szekvenálással két módszer a genom szekvenálására.
• Mindkét szekvenálási eljárás során a lebontott fragmentumok összeillesztése az átfedő régiók azonosításával történik.
• Ezenkívül a DNS kisebb fragmentumokra való lebontására is szükség van mind a klón, mind a fegyver szekvenáláshoz.

Mi a különbség a klón a klónszekvenálás és a lövöldözős szekvenálás között??

A klón klónszekvenálási technikával két fő lépésből áll: kromoszómák feltérképezése és klónozás. Ezzel szemben a lőfegyver szekvenálásával végzett klón nem követi ezt a két lépést; véletlenszerűen feldarabolja a DNS-szekvenciákat sok kis fragmentumra és újra összeállítja a szekvenciát az átfedő régiók megfigyelésével. Ennélfogva ez a legfontosabb különbség a klónok klónszekvenálás és a fegyverszekvenálás között. Ez a tényező miatt a klónos klónozással történő szekvenálás költséges és időigényes folyamat, míg a klón által végzett pisztoly-szekvenálás gyorsabb és olcsóbb.

Az összeállítás során fellépő hibák azonban kevésbé valószínű, hogy klónok során szekvenálják a klónt. Ezért nagy megbízhatósággal rendelkezik. A lőfegyver szekvenálásával végzett klónozás azonban viszonylag kevésbé megbízható technika. Tehát, ez szintén jelentős különbség a klónok klónszekvenálás és a lövöldözős szekvenálás között.

Az alábbi információs grafika további információkat tartalmaz a klón klón szekvenálás és a fegyver szekvenálás közötti különbségről.

Összegzés - Klónozás klónszekvenálás és lövöldözős sorrend szerint

Összegezve a klónok klónszekvenálás és a fegyverszekvenálás közötti különbséget, a klónok klónos szekvenálással és a fegyverszekvenálással két módszer a genom szekvenálására. A klón klón szekvenálás technikája azonban magában foglalja mind a genom feltérképezését, mind a klónozást, míg a klón szekvenálásával nem. Tehát ez a legfontosabb különbség a klónok klónszekvenálás és a lövöldözős szekvenálás között. Mivel a genom leképezésére klón során klónszekvenálás útján kerül sor, a hibák kevésbé valószínűek a szekvenciák összeállításakor. A pisztoly szekvenálásával végzett klónozás azonban sokkal gyorsabb és olcsóbb folyamat. Ennek ellenére viszonylag kevésbé megbízható. A klónozás klónszekvenálással volt az előnyben részesített módszer az 'Human Genome Project' során. De a mai molekuláris biológus inkább a klónokra támaszkodik, puskafegyver-szekvenálással.

Referencia:

1. „Mi a klónonkénti szekvenálás?” Tények, a Wellcome Genome Campus nyilvános elkötelezettségének csoportja, 2014. november 17., elérhető itt.
2. „Mi a lövöldözős sorrend?” Tények, a Wellcome Genome Campus nyilvános elkötelezettségének csoportja, 2014. november 17., elérhető itt.

Kép jóvoltából:

1. Alexpicardal97 „Molekuláris klónozás lépései” - Saját munka, CC BY-SA 4.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. „Shotgun sequencing lg”, a Nemzeti Humán Genom Kutató Intézet - Nemzeti Egészségügyi Intézetek. Nemzeti Humán Genom Kutató Intézet. “A genetikai kifejezések beszélő szószedete.” Beolvasva 2016. november 17-én (Public Domain) a Commons Wikimedia segítségével