Különbség az Exome és a Transcriptome között

Fő különbség - Exome vs Transcriptome
 

Egy gén kódoló és nem kódoló régiókat tartalmaz benne. A kódoló szekvenciákat exonoknak, a nem kódoló szekvenciákat intronnak nevezzük. A gén exonjainak nukleotidszekvenciája reprezentálja a gén genetikai kódját, amely a specifikus fehérjét szintetizálja. Ezért az exonok maradnak az mRNS-molekulában. A genom teljes exon régióját exome néven ismerték, és ez a genom fontos része. A gének genetikai kódját átalakítják az mRNS molekula genetikai kódjává, amelyre a fehérjetermeléshez szükség van. A sejtekben vagy a sejtpopulációkban egy időben átírt teljes mRNS-molekulákat transzkriptómának nevezzük. A legfontosabb különbség az exome és a transzkriptom között az Az exome a genom exon régióinak szekvenciáit képviseli míg A transzkriptom egy sejt vagy szövet teljes mRNS-ét képviseli egy adott időben.

TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi az Exome?
3. Mi az a Transcriptome?
4. Side by side összehasonlítás - Exome vs Transcriptome
5. Összegzés

Mi az Exome??

A gének exonokból, intronokból és szabályozó szekvenciákból állnak. Az exonok azok a génrégiók, amelyeket a transzkripció során mRNS-szekvenciába írunk át. Az intronokat és más nem kódoló régiókat eltávolítják a transzkripció során. Az exonok nukleotidszekvenciája meghatározza annak a génnek a genetikai kódját, amely szintetizálja az általa kódolt specifikus fehérjét. Csak egy fehérje mRNS-ében maradnak exonok. Az exonoknak a genomban történő gyűjtését egy szervezet exómának nevezzük. Ez képviseli a genom egy részét, amelyet gének expresszálnak. Az emberekben az exome a genom 1% -át teszi ki. Ez a humán genom fehérjét kódoló része.

01. ábra: Exome

Mi az a Transcriptome??

A transzkriptom az összes fehérjét kódoló és nem kódoló transzkriptum (RNS) gyűjteménye egy adott szövetben. A transzkriptom a sejtekben vagy szövetekben a gének által kifejezett összes mRNS molekulák gyűjteményét képviseli. Egy sejt transzkriptomája változtatható egy másik sejttípus transzkriptómájával. A transzkriptóma szintén dinamikus - az idővel változik, mind a belső, mind a külső ingerekre reagálva. Még ugyanazon szövetben vagy ugyanazon sejttípuson belül, a transzkriptóma néhány perc múlva megváltozhat.

A transzkriptom eltér a szervezet exómától. A transzkriptom csak az expresszált exome szekvenciákat tartalmazza. Bár a sejt exóma változatlan, a transzkriptóma különbözik a sejtek között, mivel a génexpresszió nem minden sejtben vagy szövetben azonos. Csak az esszenciális gének expresszálódnak a különböző sejtekben és szövetekben. A gén expresszió szövet- vagy sejttípus-specifikus folyamat. Különböző tényezők szabályozzák, beleértve a környezeti tényezőket is. Ezért a transzkriptóma a külső környezeti feltételektől függően változhat.

A transzkriptomert a proteomikai vizsgálatok előfutáraként használják. Az összes fehérje mRNS-szekvenciákból származik. A transzlációs módosítások megváltoztathatják a fehérjéket. A transzkriptom azonban fontos alapvető információkat nyújt a proteomikai vizsgálatokhoz.

02 ábra: Embrionális őssejtek transzkriptomája

Mi a különbség az Exome és a Transcriptome között??

Exome vs Transcriptome
Az Exome a gének fehérjét kódoló régiójának gyűjteménye.	A transzkriptom az összes átírt RNS gyűjteménye, beleértve az mRNS-t.
Minta
Az exome-t DNS mintával vizsgáljuk.	A transzkriptomot RNS-mintával vizsgáljuk.
Vizsgálati módszer
A teljes exome szekvenálás az exome tanulmányozásának módszere.	Az RNS szekvenálás a módszer a transzkriptóma tanulmányozására.

Összegzés - Exome vs Transcriptome

Az exonok a gének kódoló szekvenciái, amelyek meghatározzák a fehérjék mRNS szekvenciáit. Ezeknek a kódoló szekvenciáknak (exonoknak) a gyűjtése egy szervezet exómaként ismert. A géneket átírják mRNS-molekulákba a fehérjék előállítása előtt. A sejtek vagy szövetek összes mRNS-molekuláját adott időben transzkriptomnak nevezzük. A transzkriptom a géneket reprezentálja, amelyeket adott időben aktívan expresszálnak mRNS-be. A transzkriptom sejt- és szövet-specifikus, és befolyásolja a környezeti feltételeket. Ez a különbség az exome és a transcriptome között.

Irodalom:
1.Sarah és munkatársai: „Tizenkét emberi kimenetel célzott elfogása és masszív párhuzamos szekvenálása”. Természet. Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Orvostudományi Könyvtára, 2009. szeptember 10. Web. 2017. április 01
2.Mutz et al. “Transzkriptomelemzés a következő generációs szekvenálással.” Elsevier: Cikk kereső. N.p., 2012. szeptember. Web. 2017. április 01

Kép jóvoltából:
1. „A pluripotens sejtek transzkriptoma”: Grskovic, M. és Ramalho-Santos, M., A pluripotens transzkriptom (2008. október 10.), StemBook, szerk. Az őssejtkutató közösség, a StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook 2. ábra: A pluripotens sejtek transzkriptuma.Grskovic, M. és Ramalho-Santos, M., A pluripotens transcriptome (2008. október 10.), StemBook, ed. A őssejtkutató közösség, a StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, (CC BY 3.0) a Commons Wikimedia segítségével