Különbség a maximális Parsimony és a maximális valószínűség között

Az kulcs különbség A maximális szétválasztás és a maximális valószínűség között a filogenetikai fa kifejlesztésénél alkalmazott módszer függ. A maximális szelídítés a teljes karakterállapot minimalizálására összpontosít a filogenetikus fa felépítése során, míg a legnagyobb valószínűség statisztikai megközelítés a filogenetikai fa rajzolásához, a genetikai adatok közötti valószínűségtől függően..

A filogenia az organizmusok osztályozásának és nómenklatúrájának új megközelítése. A filogenia genetikai adatokra és evolúciós kapcsolatokra támaszkodik. A genetikai adatok a DNS-szekvenálás eredménye. A filogenezisben az organizmusok osztályozása a közös ős alapján történik. A filogenetikai kapcsolat maximális meghallgatása és maximális valószínűsége növeli a filogenetikai fa pontosságát és megbízhatóságát.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a maximális Parsimony? 
3. Mi a maximális valószínűség?
4. A maximális Parsimony és a maximális valószínűség közötti hasonlóságok
5. Side by side összehasonlítás - Maximális Parsimony vs. Maximális valószínűség táblázatos formában
6. Összegzés

Mi a maximális Parsimony??

A maximális parsimónia technikájában a teljes karakterállapot-változások minimalizálására a filogenetikai elemzés során kerül sor. A filogenetika a biológia egyik ága, amely az evolúciós kapcsolatok tanulmányozásával foglalkozik. A filogenetikus fa olyan fa, amely megmutatja az evolúciós kapcsolatokat egy közös őse alapján. Így, amikor egy filogenetikai fát rajzol a maximális szarvasság fogalmával, a párhuzamos evolúció mennyisége minimálisra csökken. Ezért a maximális szabadalom sokkal gyorsabban generálja a fát, mint más módszerek. Ennek oka az, hogy csak a fő megkülönböztető tulajdonságokat veszik figyelembe a maximális szabadalomban.

01. ábra: Maximális szavatosság

Amikor egy maximális véletlenszerű fát rajzol, a fa mindig a lehető legrövidebb fa, minimális taxonszámmal. A maximálisan véletlenszerű fa megbízhatósága azonban nagyon magas. A filogenetikai kapcsolat statisztikai konzisztenciája és pontossága a maximális szentimmon alapján változik. Ezen túlmenően vannak olyan komplex algoritmusok, amelyek a filogenetikai kapcsolat maximális példáját elemzik.

Mi a maximális valószínűség??

A maximális valószínűség az egyik leggyakrabban alkalmazott statisztikai módszer, amely a filogenetikai összefüggéseket elemzi. A módszer a filogenémiát a valószínűségi modell alapján elemzi. Ez a módszer figyelembe veszi mind az átlagot, mind a varianciát. Így a filogenezisben a maximális valószínűség érhető el egy adott szervezet adott genetikai adatainál.

02. Ábra: A legnagyobb valószínűség

A maximális valószínűség statisztikai módszerének előnyei és hátrányai is vannak. A módszer nagyon megfelelő genetikai információkat tartalmazó egyszerű adatkészlet elemzésekor. Ha a genetikai adatok variancia-foka alacsonyabb, akkor a maximális valószínűség pontszáma megbízható. A maximális valószínűséggel kapott eredmények tovább erősítik egy adott filogenetikai kapcsolat maximális szétválasztási pontszámát. Ezért a maximális valószínűség elemzése megerősítő tesztként működik.

A fentebb említett előnyökkel összehasonlítva ez a módszer lassú és intenzív folyamat. Ezenkívül egyetlen adatkészlet hiányában a hibakimenet magas. Így a maximális valószínűség becslésével az eredmények reprodukálhatóságát is megnehezíti.

Milyen hasonlóságok vannak a maximális Parsimony és a maximális valószínűség között??

• A maximális meghallgatás és a legnagyobb valószínűség két olyan megközelítés, amelyek fontos szerepet játszanak a filogenezisben.
• Mindkét módszer a rendelkezésre álló genetikai adatok alapján ábrázolja egy szervezet kapcsolatát az őseivel.
• A filogenetikai fák a maximális szarvasmarhák és a legnagyobb valószínűség felhasználásával is értelmezhetők.
• Mindkét módszer esetében a genetikai adatok a DNS szekvenálásra vagy az RNS szekvenálásra támaszkodnak.
• Mindkét módszer fontos a filogenetikai fák generálásában.

Mi a különbség a maximális Parsimony és a maximális valószínűség között??

A filogenetikai fa értelmezése során mind a maximális szánalom, mind a maximális valószínűség két különféle megközelítés. A maximális szabadalom szerint kevés tulajdonságot elemez, és minimalizálja a karakterisztikát az organizmusról organizmusra. Ezzel szemben a maximális valószínűség módszer figyelembe veszi mind az átlagot, mind a varianciát, és maximális valószínűséget nyer az adott szervezet adott genetikai adatai alapján. Szóval, ez a legfontosabb különbség a maximális szabadalom és a maximális valószínűség között.

Ezenkívül a maximális szavatosság megbízhatósága önmagában nem elegendő a következtetés levezetéséhez. A maximális valószínűség módszer azonban megerősíti a maximális szabadalom eredményeit. Ezért a következtetéseket mind a maximális szabadalom, mind a maximális valószínűség felhasználásával kell megtenni.

Az alábbi infographic összefoglalja a különbség a maximális szétválasztás és a legnagyobb valószínűség között.

Összegzés - Maximális Parsimony vs Maximum Likelihood

A filogenezis fontos szerepet játszik az evolúciós kapcsolatok levezetésében azáltal, hogy filogenetikai fákat épít fel. A maximális szabadalom olyan fa felépítésének technikája, amelyben a karakterek minimális száma megváltozik. Ezzel szemben a filogenetikai fa maximális valószínűsége a genetikai adatok maximális hasonlóságának használatán alapszik. Mindkét elemzés adatai a DNS vagy az RNS szekvencia adataiból származnak. A megbízhatóság és a pontosság magas, ha a faépítés mindkét technika alkalmazásával történik. Ez tehát összefoglalja a maximális szavatosság és a maximális valószínűség közötti különbséget.

Referencia:

1. Elliott. „Verseny a Parsimony és a valószínűség között.” OUP Academic, Oxford University Press, 2004. augusztus 1., elérhető itt.

Kép jóvoltából:

1. „A B2b csoport haszonnövényének legnagyobb fafaja” Taboada-Echalar P, Álvarez-Iglesias V, Heinz T, Vidal-Bralo L, Gómez-Carballa A, Catelli L, et al. (2013) A kolokiális korszak genetikai öröksége a kortárs bolíviaiakban. PLOS ONE 8 (3): e58980. doi: 10.1371 / journal.pone.0058980 (CC BY 2.5) a Commons Wikimedia-on keresztül
2. „A Lactarius blennius és a relativumok maximális valószínűségű fája” Felhasználó szerint: Thkgk - Saját munka (CC0) a Commons Wikimedia segítségével