Különbség a szonda és a primer között

Fő különbség - Szonda vs Alapozó
 

A molekuláris próba egy kicsi DNS vagy RNS fragmentum, amely felismeri a komplementer szekvenciákat a DNS-ben vagy RNS-ben és lehetővé teszi a célszekvencia azonosítását. A primer egy kis DNS-vagy RNS-szakasz, amely a DNS-szintézis kiindulópontjául szolgál. A primerek és a próbák hibridizálódnak a templát DNS vagy a cél DNS komplementer nukleotidjaival. A szonda és az alapozó közötti fő különbség azonban az primerekre van szükség a DNS replikációjához, míg próbákhoz szükség van a specifikus szekvenciák kimutatására a minta DNS-ben.

TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a szonda?
3. Mi az alapozó?
4. Összehasonlítás egymással - Szonda vs Alapozó
5. Összegzés

Mi a szonda??

A próba egy DNS vagy RNS kis fragmentuma, amelyet a mintában lévő cél-DNS vagy RNS molekuláris hibridizációval történő kimutatására használnak. Más néven molekuláris markerek. A próba hossza változhat (100-1000 bázis), és a próba nukleotidjai komplementer a célszekvencia részével. A detektálás megkönnyítése érdekében a próbákat radioaktív izotópokkal vagy fluoreszcens festékekkel vagy antitestekkel jelöltük. A próbák a célszekvencia komplementer bázisaival kötődnek, és felfedik a cél-DNS vagy RNS jelenlétét a mintában. A szonda címkézésének két fő módja van: végén címkézés és becenév fordítás. A próbákat különféle kategóriákba sorolhatjuk, ideértve a DNS próba, az RNS próbát, a cDNa próbát és a szintetikus oligonukleotid próbát, és különféle módszerekkel készülnek..

A próbák fontos eszközök számos mikrobiális és molekuláris területen, például virológiában, törvényszéki patológiában, apasági vizsgálatban, DNS-ujjlenyomatokban, genetikai betegségek kimutatásában, RFLP-ben, molekuláris citogenetikában., in situ hibridizáció stb.

01. ábra: A FISH-ban a patogének kimutatására használt fluoreszcensen jelölt próba

Mi az alapozó??

A primer egy rövid DNS vagy RNS fragmentum, amely iniciátorként szolgál a DNS szintéziséhez. A DNS polimeráz enzim nukleotidokat ad a primer szekvencia 3 'OH csoportjához és szintetizálja az új szálat, kiegészítve a templát DNS-t. A primerek nagyon rövid fragmensek, amelyek hossza 18-20 nukleotid. Kémiai úton szintetizálják őket a laboratóriumban in vitro DNS amplifikáció (PCR). A primereknek bármilyen nukleotidszekvenciája lehet, mivel ezeket a felhasználó tervezte. Szintetizálják őket, hogy illeszkedjenek a templát DNS komplementer bázisaihoz. Ezért bármilyen nukleotidszekvencia lehet. A primerek rendkívül fontosak a DNS replikációjához, mivel a DNS-polimeráz nem képes szintetizálni új DNS-t egy már létező DNS-elem nélkül. A PCR primerek tervezésekor a következőket kell figyelembe venni:

• A primereknek komplementer nukleotidokat kell tartalmazniuk az amplifikálni kívánt DNS szomszédos végéhez.
• Az alapozók olvadási hőmérséklete 55 és 65 ° C között legyen ⁰C
• A G és C tartalomnak 50–60% -nak kell lennie.

Két primert használunk a PCR-ben előre és fordítva a minta DNS mindkét szálának replikálására. A primereket általában használják a PCR és a DNS szekvenálás elvégzésére.

02 ábra: Alapozó izzítás PCR-ben

Mi a különbség a szonda és a Primer között??

Szonda vs Alapozó
A próba a DNS / RNS kis fragmentuma, amelyet a mintában a célszekvencia jelenlétének molekuláris hibridizációval történő kimutatására használnak..	A primer egy kis DNS vagy RNS szakasz, amely kiindulási pontként szolgál a DNS replikációjához.
Funkció
Ez kimutatja egy specifikus szekvencia jelenlétét a DNS vagy RNS mintájában.	Ez kiindulási pontként szolgál a DNS szintéziséhez.
Hossz
A hossza 100 - 1000 bázis tartományban lehet	A hossza általában körülbelül 18 - 20 bázis
Kötés komplementer szekvenciával
A próba hibridizál a célszekvencia komplementer bázisaival	Primer izzadás a DNS-szálak komplementer bázisaival.
Címkézés
A szondákat a felismerés megkönnyítése érdekében címkézik	Az alapozókat általában nem címkézik
Használat PCR-ben
A próbákat nem használják a PCR-ben	A primereket használják a PCR-ben

Összegzés - Szonda vs Alapozó

A próba egy DNS- vagy RNS-szekvencia egy kis fragmentuma, amelyet komplementer nukleotidokkal hibridizálni lehet a célszekvencia kimutatására a mintában. A próbákat radioaktív, immunológiai vagy fluoreszcens módon jelöljük, hogy megfigyeljük a célszekvencia jelenlétét. A primer egy nagyon kicsi DNS vagy RNS fragmentum, amely kiindulási pontként szolgál in vitro DNS amplifikáció. A DNS-polimeráz azonosítja a 3 'OH-csoport primerjét, és megindítja a templáthoz kiegészítő új szál felépítését. A próbák és a primerek hasonló módon működnek, komplementer nukleotidokkal hibridizálva. Így a szonda és a primer közötti kulcsfontosságú különbség a fő funkciójuk.

Referencia:
1. „Primer (molekuláris biológia).” Wikipedia. Wikimedia Alapítvány, 2017. február 2. Web. 2017. március 01.
2. Hibridizációs szonda. Wikipedia. Wikimedia Alapítvány, 2016. december 30. Web. 2017. március 01
3. „Primer (molekuláris biológia).” Primer (molekuláris biológia) - ScienceDirect témák. N.p., n.d. Web. 2017. március 01

Kép jóvoltából:
1. „HAL bakteriális kórokozók azonosításához”, Pepetps Togopic Ivan Akira, Magnus ManskeTimothy W. Ford - (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. Richard Wheeler (Zephyris) „Primers RevComp Melted2” - Saját munkája (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével