Az kulcs különbség a proteomika és a metabolomika között ez A proteomika a szervezet összes proteinjének, míg a metabolomika a szervezet összes metabolitjának tanulmányozása.
A genomika a szervezet genetikai felépítésének tanulmányozása. A proteomika és a metabolomika a genomikához kapcsolódó két omik tudomány. A proteom a sejtek vagy egy organizmus összes proteinjére vonatkozik. A metabolizmus viszont a szervezet összes metabolitjára vonatkozik. Tehát a proteom vizsgálata a proteomika, míg a metabolom vizsgálata a metabolomika. Mind a proteomika, mind a metabolomika fontos a betegségek diagnosztizálásában, valamint az organizmusok jellemzésében és szűrésében. Sőt, mindkettő a sejtbiológia sok szempontjából kapcsolódik egymáshoz, különös tekintettel a sejtek jelátvitelére, a fehérje lebontására, valamint a generációra és a poszt-transzlációs módosításra..
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi az a proteomika?
3. Mi a metabolizmus?
4. A proteomika és a metabolizmus hasonlóságai
5. Összegzés összehasonlítása - Proteomika vs anyagcsere táblázatos formában
6. Összegzés
A proteóma a sejtekben, szövetekben vagy szervezetekben található teljes fehérjekomplementum. Ezért a proteomika a szervezet proteómájának vizsgálata. A proteomikában a fehérjék különböző tulajdonságait elemezzük. Ezért a proteomika elsősorban a fehérjék szerkezetére, orientációjára, funkcióira, fehérje kölcsönhatásaira, módosítására, alkalmazására és a fehérjék fontosságára összpontosít. Ezért jelenleg sok kutatási projektet végeznek a proteomika területén.
Az első proteomikai vizsgálatokat az Escherichia coli fehérjetartalmának azonosítására végezték el. Az összes fehérjetartalom feltérképezését kétdimenziós (2D) gélekkel végeztük. A projekt sikere után a tudósok az állatok, például tengerimalacok és egerek teljes fehérjetartalmának jellemzésére haladtak. Jelenleg az emberi fehérje térképezését 2D gélelektroforézissel végezzük.
A proteomika tanulmányozásának számos előnye van, mivel a fehérjék a fehérjék katalitikus tulajdonságai miatt a legtöbb aktivitást okozó molekulák. Így a teljes fehérjék vizsgálata információt nyújthat a szervezet egészségi állapotáról. Ezenkívül a proteomika számos alkalmazásban részesíti a genom annotációját, a betegségek azonosítását és diagnosztikáját, a fehérje expressziós vizsgálatokat a kísérletek során, valamint a fehérje módosításokat és interakciós vizsgálatokat stb..
01. ábra: Proteomika
Különböző technikák vannak a proteomikában, beleértve a teljes fehérje extrahálását, elválasztását 2D gélelektroforézissel, az extrahált fehérjék szekvenálását olyan módszerekkel, mint Edmund szekvenálási módszer vagy tömegspektrometria, valamint a fehérje szerkezeti és funkcionális tulajdonságainak elemzését számítógépes szoftverek és bioinformatikai eszközök.
A metabolizmus az összes metabolit tanulmányozása egy sejtben, szövetben vagy egy szervezetben. Ez magában foglalja a celluláris metabolitok azonosítását és mennyiségi meghatározását különböző fejlett analitikai és statisztikai eszközökkel. A metabolizmus fontos tanulmány, mivel információkat tár fel a szervezet anyagcseréjéről.
02 ábra: Metabolómia
A metabolikus reakciók szubsztrátjainak és termékeinek tanulmányozására a metabolomika analitikai platformként tömegspektrometriát alkalmaz. A tömegspektrometria metabolitokat és koncentrációkat eredményez, tükrözve a sejtek vagy szövetek valós biokémiai állapotát. Ezért a metabolomika tekinthető a szervezet molekuláris fenotípusának legjobb ábrázolásának. Ezen túlmenően a metabolomika a proteomika kiterjesztésének tekinthető, mivel a legtöbb metabolit az enzimek aktivitása miatt keletkezik, amelyek fehérjék.
A proteomika a fehérjék nagyszabású vizsgálata, ideértve azok szerkezetét és funkcióját egy sejtben vagy egy organizmusban. Eközben a metabolomika a metabolitprofilok vizsgálata egy sejtben, szövetben vagy szervezetben egy adott körülmények között. Tehát ez a legfontosabb különbség a proteomika és a metabolomika között. Ezenkívül a proteomika elsősorban a teljes fehérjekészletet érinti, míg a metabolomika elsősorban a metabolitok teljes készletét érinti, ideértve a különféle apró molekulákat, például peptideket, szénhidrátokat, lipideket, nukleozidokat és exogén vegyületek katabolikus termékeit stb. másik különbség a proteomika és a metabolomika között.
Az alábbi infographic összefoglalja a proteomika és a metabolomika közötti különbséget.
Az élő organizmusokat genomjuk, fehérjék és metabolitjaik felhasználásával lehet megvizsgálni. A genomika, a proteomika és a metabolomika a három terület, amelyek a sejtek vagy a szervezetek genetikai felépítését, fehérjéit és metabolitjait vizsgálják. A proteomika fontos, mivel ez mind a gének, mind a környezet dinamikus visszaverése. A metabolizmus nagyon fontos, mivel közvetlenül tükrözi a sejtek biokémiai reakciójának jelenlegi állapotát vagy egy szervezet metabolikus állapotát. Ez tehát összefoglalja a proteomika és a metabolomika közötti különbséget.
1. P, Surat. "Hogyan kapcsolódnak a metabolizmus és a proteom?" Hírek, 2019. február 26, elérhető itt.
2. Horgan, Richard P és Louise C Kenny. „SAC áttekintés az„ Omic ”technológiákról: genomika, transzkriptika, proteomika és anyagcsere.” Szülészet és nőgyógyászat, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 2011. július 18., Elérhető itt.
1. „Proteomics” az Xxl7441 által az angol Wikibooksban - átvitt az en.wikibooks oldalról a Commonsba. (Public Domain) a Commons Wikimedia-on keresztül
2. „Metabolómiai séma”: Lmaps (beszéd) - Ezt a munkát teljesen saját magam készítettem (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével