Különbség a proteomika és a transzkriptika között

Fő különbség - Proteomika vs transzkriptika
 

Az omic technológia jelenlegi tendencia, ahol a szervezet különféle biomolekuláit egészének tekintik tulajdonságainak és funkcióinak szempontjából. Az omic technológia széles körű alkalmazásokat kínál. A biológiai minta különféle omikjai közé tartozik a genomika, a proteomika, a transzkriptika és a metabolomika. A proteomika magában foglalja az élő szervezetekben lévő összes fehérje teljes vizsgálatát. Ez a szervezetben kifejezett összes fehérje halmaza, annak szerkezeti és funkcionális tulajdonságai. Ezért a teljes fehérjekészlet képezi a proteomát. A transzkriptika az élő szervezetben jelen lévő összes hírvivő RNS (mRNS) molekulának a teljes vizsgálata. Így a transzkriptika az élő szervezetben aktívan expresszálódó génekkel foglalkozik. Az élő organizmusban az összes mRNS-készletet transzkriptomnak nevezzük. Az kulcs különbség A proteomika és a transzkriptika között a biomolekula típusa alapul. A proteomikában az élő organizmusban kifejezett fehérjék teljes készletét tanulmányozzuk, míg a transzkriptikában az élő szervezet teljes mRNS-ét vizsgáljuk.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi az a proteomika?
3. Mi az a transzkriptika?
4. A proteomika és a transzkriptika hasonlóságai
5. Side by side összehasonlítás - Proteomika vs transzkriptika táblázatos formában
6. Összegzés

Mi az a Proteomics??

A proteomika kifejezést 1995-ben hozták létre, és kezdetben a sejtekben, szövetekben vagy szervezetekben levő teljes fehérjekomplementumként definiálták. A proteomikai tanulmányok fejlődésével később azt úgy módosították, hogy az átfogó kifejezés legyen, amelybe számos tanulmányt beillesztettek. Jelenleg a proteomika témakörben tanulmányozzuk a fehérjék szerkezetét, orientációját, funkcióit, kölcsönhatásait, módosításait, alkalmazását és a fehérjék fontosságát. Ezért jelenleg sok kutatást végeznek a proteomika területén.

Az első proteomikus vizsgálatokat a fehérjetartalom azonosítására végezték Escherichia coli. Az összes fehérjetartalom feltérképezését kétdimenziós (2D) gélekkel végeztük. Ennek sikere után a tudósok átmentek az állatok, például tengerimalacok és egerek teljes fehérjetartalmának jellemzésére. Jelenleg az emberi fehérje térképezését 2D gélelektroforézissel végezzük.

A proteomika alkalmazásai

A proteomika tanulmányozásának számos előnye van, mivel a fehérjék a fehérjék katalitikus tulajdonságai miatt az aktivitás nagy részének vezető molekulái. Így a teljes fehérjék vizsgálata információt nyújthat a szervezet egészségi állapotáról. Néhány alkalmazás;

1. Genomjegyzet: A szervezet fehérjetartalmának tanulmányozásával meg lehet határozni az aktív fehérjevegyületért felelős pontos genomokat. Ebben a forgatókönyvben az összes genomika, a transzkriptika és a proteomika eredményei fontosak.
2. A betegség azonosítása / diagnosztika: A proteomikát használják a betegség azonosításához, az egészséges és a betegek összehasonlításával
3. Végrehozni fehérje expresszió a kísérletezés során tanulmányozták.
4. Fehérjemódosítások és interakciós vizsgálatok: Annak érdekében, hogy fehérjéket használjon vitro feltételek vagy és in vivo körülmények között, az extrahált fehérjék tárolási körülményeinek meghatározása és a fehérje viselkedésének tanulmányozása céljából in vitro, in vivo és in - silico módszerek.

01. ábra: Proteomika

Különböző technikák léteznek a proteomikában

1. A teljes fehérje extrahálása és a fehérjék elválasztása 2D gélelektroforézissel. A fehérjéket nagy teljesítményű folyadékkromatográfiával (HPLC) is elválaszthatjuk.
2. Az extrahált fehérjék szekvenálása olyan módszerekkel, mint Edmund szekvenálási módszer vagy tömegspektrometria.
3. A szekvenciák azonosítása után a fehérjetartalom szerkezeti és funkcionális tulajdonságait elemezzük számítógépes szoftver és bioinformatikai eszközök használatával.

Mi az a transzkriptika??

A transzkriptom kifejezést nemrégiben hozták létre. A transzkriptika a szervezet teljes mRNS-tartalmának tanulmányozása. A teljes mRNS egy élő szervezetben vagy egy sejtben expresszált DNS. Az mRNS teljes gyűjteményét transzkriptomnak nevezzük.

A transzkriptóma elemzésének lépései között szerepel,

1. Az RNS extrahálása, az mRNS elválasztása oszlopgél-kromatográfiával poli-DT gyöngyökkel.
2. Az mRNS szekvenálását elvégezzük.

A mikroarray technológia egy általános módszer a szervezet transzkriptómájának azonosítására. A mikrotáblás eljárás magában foglal egy próbalemezt a transzkriptom komplementer szálaival. Hibridizációval jellemezhető a szervezetben vagy a sejtekben levő mRNS.

02 ábra: Átírási technikák

A transzkriptikát széles körben használják az orvosi területen. A betegségek diagnosztizálása és a betegségek profilozása azok a fő területek, amelyekben a transzkriptikát használják. Egy szervezet transzkriptómájának elemzésével idegen mRNS azonosítható, és ha vannak fertőzések, akkor azonosíthatók. A nem kódoló RNS transzkriptikus technológiák segítségével választható el. Emellett a gének expressziója nyomon követhető különféle környezeti stressz hatására is.

 Mik a hasonlóságok a proteomika és a transzkriptika között??

• Mindkettő része az omic technológia fogalmának.
• Mindkettőt betegségek diagnosztizálására és egy organizmus jellemzésére használják.
• Mindkét vizsgálati terület a biomolekula extrahálását, a biomolekula elválasztását és a szekvenálási lépéseket foglalta magában.

Mi a különbség a proteomika és a transzkriptika között??

Protemika vs transzkriptika
A proteomika magában foglalja az élő szervezetekben lévő összes fehérje teljes vizsgálatát.	A transzkriptika az élő szervezetben jelen lévő összes hírvivő RNS (mRNS) molekulának a teljes vizsgálata.
Tanulmányozott biomolekula típus
A fehérjéket a proteomikában tanulmányozták.	Az mRNS-t transzkriptikában tanulmányozták.
Tanulmányozott tényezők
A fehérjék szerkezetét, működését, kölcsönhatásait, módosításait és alkalmazását a proteomikában vizsgálják.	A szekvencia felépítését, a környezettel való kölcsönhatásokat és az mRNS alkalmazását a transzkriptika tanulmányozzák.

Összegzés - Proteomika vs transzkriptika 

Az omika fontos szerepet játszik az élettudományok területén. A proteomika arra a proteomára utal, amely egy sejtben vagy egy szervezetben a fehérjék teljes gyűjteményét képezi. A transzkriptika arra utal, hogy tanulmányozzuk a transzkriptomot, amely az expresszált DNS teljes halmaza, amely mRNS formájában van. A két vizsgálati terület, a proteomika és a transzkriptika, a genomika bevezetése után származik, és jelenleg széles körben alkalmazzák az orvosi diagnosztikában, valamint az organizmusok jellemzésében és szűrésében. Ez a különbség a proteomika és a transzkriptika között.

Töltse le a Proteomics vs Transcriptomics PDF-jét

Letöltheti a cikk PDF változatát, és offline célokra felhasználhatja, az idézet megjegyzésének megfelelően. Töltse le a PDF verziót itt: Különbség a proteomika és a transzkriptika között

Referencia:

1.Horgan, Richard P és Louise C Kenny. „Omic” technológiák: genomika, transzkriptika, proteomika és metabolomika. ” Szülészeti és nőgyógyász, Blackwell Publishing Inc., 2011. július 18  
2.Graves, Paul R. és Timothy A. J. Haystead. „Molekuláris biológus útmutató a proteomikához.” Mikrobiológiai és molekuláris biológiai áttekintések, Amerikai Mikrobiológiai Társaság, 2002. március. Elérhető itt
3.Lowe, Rohan és mtsai. „Transzkriptikai technológiák.” PLoS Computational Biology, Tudományos Nyilvános Könyvtár, 2017. május. Elérhető itt  

Kép jóvoltából:

1.'Proteomics'By Xxl7441 az angol Wikibooksban - Átváltva az en.wikibooks-ról a Commons-ra., (Public Domain) a Commons Wikimedia-on keresztül
2.'Mikro-tömb és szekvenáló áramlási cella 'Thomas Shafee - Saját munka, (CC BY 4.0) a Commons Wikimedia-on keresztül