Különbség az shRNS és az siRNS között

shRNS vs siRNA

Az RNS-interferencia (RNAi) folyamata során a célgén expresszióját nagy specificitással és szelektivitással leütödik. Az RNSi természetes folyamat, és magában foglalja a kicsi interferáló RNS-t (siRNS) és a rövid hajtűs RNS-t (shRNS) és a bi-funkcionális shRNS-t. Jelenleg az RNAi-t széles körben használják a személyre szabott rákterápia eszközeként. Az RNSi alkalmazását alapvetően a kémiai úton szintetizált kettős szálú siRNS és vektor alapú shRNS molekulákkal végzik. Bár e két molekula hasonló funkcionális eredménnyel rendelkezik, szerkezetükben különböznek egymástól; így e két molekula molekuláris hatásmechanizmusai, az RNS-útvonalak és az off-target hatások szintén különböznek.

shRNA

Az shRNS egy kis RNS-molekula olyan szekvenciája, amely szoros hajcsavart hajt végre, amely felhasználható a célgén expressziójának elnémítására az RNSi során. Az shRNS expresszióját egy vektor biztosítja, amely lehet vírus vagy baktérium, vagy plazmidok leadásával. Szintetizálódnak a sejtmagban és továbbjutnak a citoplazmába további folyamatok céljából. Ezeknek a molekuláknak a miRNS érési útjai hasonlóak; így a miRNS szintézise alapot nyújtott az shRNS szintézis megértéséhez. Bármelyik RNS-polimeráz II vagy III képes átírni az shRNS-t az RNS-polimeráz II vagy III promóterek révén. A shRNS-ek alkalmazásának előnye, hogy viszonylag alacsony a lebomlás és a forgalom. Hátránya, hogy expressziós vektorra van szüksége, amely bizonyos biztonsági problémákat okozhat.

siRNS

Az siRNS-ek kettős szálú RNS-molekulák, amelyek 20-25 bázispárból állnak. Ezeket génszuppresszióhoz használják úgy, hogy bármelyik gént elnémítják komplementer nukleotidszekvenciával az RNSi-útvonalon. A siRNS transzfekciójával történő génkibocsátás az átmeneti hatás miatt gyakran sikertelen; különösen a gyorsan megosztódó sejtekben, és a szuppresszió nem tart tovább. A probléma kiküszöbölése érdekében az siRNS-t egy rövid hajtűszerkezet bevezetésével módosítják. Ez a módosított molekula, ezt követően shRNS néven ismert. Az shRNS-t egy Dicernek SiRNS-ként kell átalakítania a normál működésének folytatása érdekében.

Mi a különbség az shRNS és az siRNS között??

• Az siRNS-szel ellentétben az shRNS extra hajtűszerkezettel rendelkezik. Az shRNS az siRNS módosított változata.

• Az shRNS expressziós vektort igényel, míg az siRNS nem.

• Az shRNS hosszú távú leütésre használható, míg az siRNS csak a gének rövid távú leütésére használható..

• Az siRNS génszuppressziójával ellentétben az shRNS elnyomása tartós, és ha megfelelő vírusvektoron keresztül illesztik be, tartós géncsendesítő hatásokat válthat ki..

• Dicerre van szükség ahhoz, hogy az shRNS visszaálljon siRNS molekulává, hogy normál funkcióit végre tudja hajtani.