Az egymásra helyezett gél és az elválasztó gél kifejezéseket az SDS-PAGE technika magyarázatához használjuk. Az SDS-PAGE vagy nátrium-dodecil-szulfát-poliakrilamid gél elektroforézis laboratóriumi technika, amelyet a fehérjemolekulák molekulatömegük alapján történő elválasztására használnak. A technika mögött meghúzódó elmélet az, hogy a különböző molekulatömegű proteinek eltérő migrációs sebességet mutatnak; az alacsony molekulatömegű molekulák gyorsabban vándorolnak, míg a nagy molekulatömegű molekulák lassan vándorolnak. A migrációs közeg gél. Kétféle gél létezik: egymásra rakódó és elválasztó gél. Az kulcs különbség az egymásra helyezett gél és az elválasztó gél között ez az az egymásra helyezett gél pH-ja 6,8, míg az elválasztó gél pH-ja 8,8.
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a záró gél?
3. Mi az elválasztó gél?
4. A kapcsolati gél és az elválasztó gél közötti kapcsolat
5. Összehasonlítás egymással - Összerakó gél vs elválasztó gél táblázatos formában
6. Összegzés
A egymásra rakódó gél alacsony koncentrációjú poliakrilamid gél, amelyet az SDS-PAGE technika alkalmazásával az koncentráltabb felbontógél (elválasztó gél) tetejére helyeznek. A halmozó gélt az elektroforézis felbontásának javítására használják. A felbontás növekszik a mintában levő proteinekre ható egymásra helyezett gél és a feloldó gél koncentrációja közötti különbség miatt. Mivel a poliakrilamid koncentrációja az egymásra helyezett gélben alacsony, a pórusméret nagyobb. Ez a szétválasztás fokozásában is segít.
A halmozó gél laza poliakrilamid gél, nagy pórusai körülbelül 7% poliakril-amid. Ezek a pórusok nem jelentik jelentős akadályt a nagy fehérjemolekulák számára. Ezért ez a gél kissé befolyásolja ezen fehérjék mobilitását. Ez elválasztja a fehérjék mobilitása és mérete alapján azáltal, hogy két gél között koncentrálják őket.
01. ábra: SDS-PAGE akril-amid gél
A halmozó gél pH-ja 6,8. PH-ja savas, mint a 2 pH-egységben feloldódó gélé. Ez a pH alacsonyabb ionerősséget jelent, ennélfogva nagyobb az elektromos ellenállás. Ez provokálja a fehérjék mobilitását, mint a gélben lévő többi töltött részecske.
Az SDS-PAGEtechnique elválasztó vagy rezolváló géle egy erősen koncentrált poliakril-amid gél, amelyet az alacsony koncentrátumú egymásra helyezett gél tetejére helyeznek. Az elválasztó gél nagy mennyiségben (10%) poliakrilamidot tartalmaz. Ennek a gélnek a pH-ját 8,8-nál tartjuk, ami magasabb pH-érték, mint a halmozó gélé.
02 ábra: Gél elektroforézis készülék
Amikor a fehérjemolekulák elérték az elválasztó gélt, ezen molekulák migrációja lelassul, mivel az elválasztó gél nagy koncentrációjú gél, kis pórusmérettel, amely jelentős akadályt jelenthet a fehérjemolekulák mozgása szempontjából. Ez a lassulás lehetővé teszi, hogy a többi fehérje lassan vándoroljon felzárkóztatáshoz, szűk, koncentrált sávot eredményezve a két gél között.
Halmozó gél vs elválasztó gél | |
A egymásra rakódó gél alacsony koncentrációjú poliakrilamid gél, amelyet az SDS-PAGE technikával az koncentráltabb felbontó gél (elválasztó gél) tetejére helyeznek.. | Az SDS-PAGE technika elválasztó vagy rezolváló géle egy erősen koncentrált poliakrilamid gél, amelyet egy alacsony koncentrációjú egymásra rakódó gél tetejére helyeznek. |
Elhelyezés | |
Az egymásra rakódó gélt az elválasztó (elválasztó) gélre helyezzük. | Az elválasztó gélt a gél elektroforéziséhez használt tartály aljára helyezzük. |
koncentráció | |
A halmozó gél koncentrációja magas. | Az elválasztó gél koncentrációja alacsony. |
Poliakrilamid tartalom | |
A egymásra helyezett gél körülbelül 7% poliakrilamidot tartalmaz. | Az elválasztó gél körülbelül 10% poliakrilamidot tartalmaz. |
pH | |
A halmozó gél pH-ja 6,8. | Az elválasztó gél pH-ja 8,8. |
Pórusméret | |
A pórusgél nagy pórusmérettel rendelkezik. | Az elválasztó gélben kis pórusméretek vannak jelen. |
Felbontás | |
A halmozott gél jobb felbontást biztosít. | Az elválasztó gél gyenge felbontást ad. |
Az egymásra helyezett gél és az elválasztó gél kétféle poliakril-amid gél, amelyeket az adott mintában a fehérjemolekulák jobb elválasztására használnak. Az egymásra helyezett gél és az elválasztó gél közötti különbség az, hogy a egymásra helyezett gél pH-ja 6,8, míg az elválasztó gél pH-ja 8,8.
1. „Poliakrilamid gél elektroforézis.” Poliakrilamid gél elektroforézis (elmélet): Molekuláris Biológia Virtuális Lab II: Biotechnológia és orvosbiológiai technika: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. Itt érhető el
2. „Hogyan működik az SDS-PAGE” Bitesize Bio, 2018. február 16. Elérhető itt
3. “SDS-PAGE halmozó gél - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew).” Google Webhelyek. Itt érhető el
1.'SDS-PAGE akril-amid gél'By Bensaccount az angol Wikipedia-ban, (CC BY 3.0) a Commons Wikimedia segítségével
2. „Gélelektroforézis-készülék” Jeffrey M. Vinocur - Saját munkája, (CC-BY 2.5) a Commons Wikimedia segítségével