Különbség az upstream és a downstream DNS között

Fő különbség - upstream vagy downstream DNS
 

Fontos, hogy általános ismeretekkel rendelkezzünk a DNS összetételéről és szerkezetéről, hogy megértsük a különbséget az upstream és downstream DNS között. A DNS polinukleotid láncokból áll. A nukleotidok azok az építőelemek, amelyek polinukleotid láncokat hoznak létre, és minden nukleotid három komponensből áll: öt széntartalmú cukorból, nitrogénbázisból és foszfátcsoportból. Egy foszfátcsoport és OH csoport kapcsolódik a nukleotidban levő cukormolekula 5 'és 3' helyzetű szénéhez. A nukleotidokat foszfodiészter kötések kötik össze, amelyek az egyik nukleotid 5 'foszfátcsoportja és a szomszédos nukleotid 3' OH csoportja között képződnek. Ha egy polinukleotid lánc szabad 5 'foszfátcsoporttal rendelkezik, akkor azt az 5' véghez rendelik; ha van egy szabad 3 'OH csoportja, akkor azt 3' végűvé kell tenni. Ezért a DNS-szálaknak általában 5 'és 3' vége van a polinukleotid láncok véghelyzete szerint. A DNS kettős szálú formában is létezik. Két szál egymással párhuzamos. Ezért a DNS-nek két szálja van, amelyek 5 '- 3' és 3 '- 5' irányba futnak. Az upstream és downstream DNS-ekre utalunk az 5 '- 3' mRNS szál transzkripciójára és szintézisére. Ha a DNS-t a kódoló szál 5 vége felé tekintjük a transzkripció iniciációs helyétől, akkor upstream DNS-ként ismertünk. Ha a DNS-t a transzkripció iniciációs helyét kódoló szál 3'-vége felé tekintjük, akkor downstream DNS-ként ismertünk. Ez a legfontosabb különbség az upstream és downstream DNS között.

TARTALOMJEGYZÉK
1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi az a upstream DNS?
3. Mi az a downstream DNS?
4. Összehasonlítás egymással - Upstream vs Downstream DNS
5. Összegzés

Mi az a upstream DNS??

A gén egy strukturális és funkcionális egység öröklődés, amely egy szervezet DNS-jén található. Egy fehérje előállítására vonatkozó utasításokkal tárolják. A génnek egy DNS-molekula specifikus régiója van. Szükség esetén egy mRNS szál szintetizálásával átírja és transzlálódik fehérjévé. Általában a gén kódoló szála 5 '- 3' irányba fut. Amikor átírják, akkor egy mRNS szálat hoz létre ugyanabba az irányba 5 '- 3'. A transzkripció során 3 '- 5' antiszensz szálat szolgált templát szálként és iniciálja az mRNS szintézist. A génben van egy transzkripciós iniciációs hely. A transzkripció iniciációs helyére hivatkozva a kódoló szál 5'-vége felé tartó DNS-régiót upstream DNS-nek nevezzük. A gén promótere általában a DNS felső szakaszában található. Az eukarióta génekben TATA dobozok, promóter proximális elemek és fokozók vannak a génnel szemben. A gén felsõ szakaszára negatív számokkal hivatkozunk. Egy gén felső szintű DNS-je rendkívül fontos a transzkripció szempontjából.

Mi az a downstream DNS??

A transzkripció iniciációs helyét gén +1 pontjának nevezzük. A DNS-régiót, amely a kódoló szál +1 pontjától a 3'-vége felé mutat, downstream DNS-ként ismertük. Más szavakkal, a gén lefelé halad a transzkripció iniciációs helyétől a templát szál 5'-vége felé. Ezért egy génrégió lefelé irányuló DNS-é transzkripciós egységet és más szekvenciákat, például terminátor szekvenciát tartalmaz. A promoter befolyásolhatja a gén alsó szakaszának szekvenciáját. A gén alsó részén pozitív számok szerepelnek. A gén alsó szakaszában levő DNS az a tényleges régió, amely a fehérjeterméket adja.

01. ábra: Upstream és downstream DNS

Mi a különbség az upstream és downstream DNS között??

Upstream vs Downstream DNS
A transzkripció iniciációs helyétől a kódoló szekvencia 5'-vége felé tartó DNS-régiót upstream DNS-nek nevezzük.	A transzkripciós iniciációs helytől származó kódoló szál 3'-vége felé tartó DNS-régiót lefelé irányuló DNS-nek nevezzük.
Elements
A promóterek és fokozók az upstream DNS-en helyezkednek el	A transzkripciós egység és a terminátor szekvenciák az áramlási irányú DNS-ben helyezkednek el.
Számozás
Az upstream régió nukleotidjait negatív számokkal jelöljük	A nukleotidok pozitív számokkal vannak jelölve.
Funkció
Ez a régió elemeket tartalmaz, amelyek szükségesek a transzkripció szabályozásához és kezdeményezéséhez	Ez a régió fehérje előállítására és a transzkripció lezárására vonatkozó utasításokat tartalmaz

Összegzés - Upstream vs Downstream DNS

Könnyen azonosítható egy RNS szál felfelé és lefelé. Ami a referenciahelyet illeti, az RNS-szál 5'-vége felé fekvő régiót upstream RNS-ként ismertük, míg a 3'-vég felé vezető régiót downstream RNS-ként ismertük. A DNS-ben azonban két olyan szál van, amelyek mindkét irányban 5 '- 3' és 3 '- 5' irányba futnak. Ezért a különbség az upstream és downstream DNS között bonyolult. Ezért differenciálódik egy gén transzkripciója alapján. A transzkripció iniciációs helyétől a szensz szál 5. vége felé a DNS-régiót upstream DNS néven ismertük, míg a transzkripciós iniciációs helytől a szensz szál 3'-vége felé az downstream DNS néven ismert. Ez a különbség a DNS upstream és downstream között.

Irodalom:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi és Jonatha M. Gott. "Megkülönböztető szerepek a szekvenciákhoz a fizarumetizáló helyekről felfelé és lefelé." RNS-t. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2009. szeptember. Web. 2017. március 18

Kép jóvoltából:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro és Luísa Romão. „A génkifejezés szabályozása az upstream nyílt olvasási keretek és az emberi betegségek által.” PLOS genetika. Tudományos Nyilvános Könyvtár, n.d. Web. 2017. március 18.