Különbség a VNTR és a STR között

Fő különbség - VNTR vs STR
 

A DNS-vizsgálatok hatalmas hasznossággal bírnak a filogenetikai kapcsolatok megértésében és meghatározásában, a genetikai betegségek diagnosztizálásában és a szervezet genomjainak feltérképezésében. Számos DNS-elemzéssel kapcsolatos technikát alkalmaznak egy adott gén vagy egy DNS-szekvencia azonosítására egy ismeretlen DNS-készletben. Genetikai markerekként ismertek. A genetikai markereket a molekuláris biológiában használják az egyének és a fajok közötti genetikai variáció azonosítására. A változó számú tandem ismétlés (VNTR) és a rövid tandem ismétlés (STR) két olyan genetikai marker, amelyek polimorfizmust mutatnak az egyének között. Mindkét típus nem kódoló ismétlődő DNS, amely tandem ismétlés. A kromoszómák fej-farok formájában vannak elrendezve. A VNTR a genom egy része, ahol a rövid nukleotidszekvenciát többször megismételjük. Az STR a DNS genomjának egy másik szakasza, amely százszor kettőtől tizenhárom nukleotidból álló ismétlődő egységekként van elrendezve. A VNTR és a STR közötti fő különbség az ismétlődő szekvencia nukleotidjainak száma. A VNTR ismétlődő egységei 10-100 nukleotidból állnak, míg a STR ismétlődő egységei 2-13 nukleotidból állnak.. A VNTR-t és az STR-et széles körben használják a kriminalisztikai vizsgálatokban.

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a VNTR? 
3. Mi az STR?
4. hasonlóságok a VNTR és az STR között
5. Összehasonlítás egymással - VNTR vs STR táblázatos formában
6. Összegzés

Mi a VNTR??

A tandem ismétlés egy rövid DNS-szekvencia, amelyet fej-farok formájában megismételnek egy adott kromoszómális lókusznál. A tandem ismétlésben nincs más szekvencia vagy nukleotid. A genomban többféle tandem ismétlés létezik. A VNTR egy olyan tandem ismétlés, amely 10–100 nukleotidból áll. A VNTR egyfajta miniszatellit. Ezek a tandem ismétlések számos kromoszómában megtalálhatók. Integrálódnak az emberi genomban, és túlnyomórészt a kromoszómák szubtelomer régióiban helyezkednek el.

 A VNTR-ek tandem ismétlődő polimorfizmust mutatnak az egyének körében. A VNTR hossza a kromoszóma egy adott helyén nagymértékben változik az egyének között, az abban a DNS-szakaszban megrendezett ismétlődő egységek számának változása miatt. Ezért a VNTR hatékony eszköz lehet az egyének azonosításában, és a VNTR elemzést számos területen alkalmazzák, ideértve a genetikát, a biológiai kutatást, a kriminalisztikát és a DNS ujjlenyomatot. A VNTR-ek voltak az első genetikai markerek, amelyeket a csontvelő-transzplantáció beültetésének mennyiségi meghatározására használtak. A VNTR-ek voltak az első polimorf markerek, amelyeket a kriminalisztikai DNS profilozásban használtak.

01. ábra: A VNTR-ek változása hat egyénben

A VNTR elemzést restrikciós fragmens hosszúságú polimorfizmus útján hajtjuk végre, amelyet déli hibridizáció követ. Ezért viszonylag nagy DNS-mintára van szüksége. A VNTR profil értelmezése szintén problematikus. Ezen korlátozások miatt a VNTR használatát a kriminalisztikai genetikában korlátozották, és helyébe STR elemzés került.

Mi az a STR??

A STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, tandem módon rendezve. STR hasonló a VNTR-hez. De a VNTR-től függ az ismétlődő szekvencia nukleotidjainak számától és az ismétlések számától. Az STR egy mikroszatellit típus.

Az ismétlődő egységek pontos számának mérésében részt vett STR elemzés. Az STR-k nagyon változatosak az egyének között, hasonlóan a VNT-khez. A STR profilok személyenként eltérőek. Ezért a STR elemzést a molekuláris biológiában használják két vagy több mintából származó DNS specifikus lókuszok összehasonlítására. Ezért az STR-eket molekuláris biológiában erőteljes genetikai markereknek tekintik. Kiváló eszköz az egyének azonosítására magas polimorfizmusuk és viszonylag rövid hossza miatt.

Jelenleg a kriminalisztikai genetika területén az STR-ek a leggyakrabban használt elemzett genetikai polimorfizmus eszköz. A legtöbb kriminalisztikai esetet STR polimorf elemzéssel kell elvégezni. A STR lókuszok eloszlanak az egész genomban. A kromoszómákban több ezer STR található, amelyek felhasználhatók a kriminalisztikai elemzéshez. Az STR elemzés nem foglal magában restrikciós hosszúságú polimorfizmust, mint például a VNTR elemzés. Az STR elemzés nem vágja le a DNS-t restrikciós enzimekkel. Specifikus próbákat alkalmazunk a kívánt régióknak a DNS-hez történő rögzítésére, és PCR technikával meghatározzuk az STR hosszát.

02 ábra: STR változás a minták között

Milyen hasonlóságok vannak a VNTR és az STR között??

• A VNTR és a STR nem kódoló DNS.
• Mindkettő tandem ismétlés.
• Mindkettő polimorfizmust mutat az egyének között a DNS-szakasz hosszának különbsége miatt.
• Mindkettőt erőteljes genetikai markerekként használják a DNS ujjlenyomatokban és a kriminalisztikai vizsgálatokban.

Mi a különbség a VNTR és az STR között??

VNTR vs STR
A VNTR egy nem kódoló ismétlődő DNS, amelynek rövid nukleotidszekvenciája megismétlődik tandem módon.	A STR egy nagyon ismétlődő DNS szakasz, amely két-tizenhárom nukleotid ismétlődő egységből áll, tandem módon rendezve.
Méret
A VNTR-ek nagyobbak, mint az STR-k.	Az STR-k kisebbek, mint a VNTR-ek.
Nukleotidok száma az ismétlődő szekvenciában
A VNTR ismétlődő egysége 10-100 nukleotidból áll.	A STR ismétlődő egysége 2-13 nukleotidból áll.

Összegzés - VNTR vs STR

A VNTR és a STR két erőteljes genetikai marker, amelyeket a molekuláris biológiában használnak, különösen a törvényszéki genetika területén. A VNTR egyfajta miniszatellit, és STR egy mikrosatellit. A VNTR és a STR nem kódoló, erősen ismétlődő DNS. Tandem ismétlések. A VNTR és a STR általános szerkezete azonos. Az ismétlődő szekvencia nukleotidjainak száma és hossza azonban eltérő. A VNTR ismétlődő szekvenciái 10-100 nukleotidból állnak. Az STR ismétlődő szekvenciái 2-13 nukleotidból állnak. Ez a különbség a VNTR és a STR között.

Töltse le a VNTR vs STR PDF verzióját

Letöltheti a cikk PDF verzióját, és offline célokra felhasználhatja, az idézethez fűzött megjegyzések szerint. Töltse le a PDF verziót itt. Különbség a VNTR és az STR között.

Irodalom:

1. „A kriminalisztikai genetika tudománya.” CRG - A Felelős Genetika Tanácsa. N.p., n.d. Web. Itt érhető el. 2017. július 10.
2. „STR elemzés.” Wikipedia. Wikimedia Alapítvány, 2017. március 22. Web. Itt érhető el. 2017. július 10.

Kép jóvoltából:

1. „D1S80Demo” PaleWhaleGail által az angol Wikipedia-ban (CC BY-SA 3.0) a Commons Wikimedia segítségével