Különbség a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás között

Az kulcs különbség a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás között az, hogy a a teljes genom szekvenáló szekvencia egy szervezet teljes genomját szekvenálja, míg az exome szekvenáló szekvencia csak a szervezet exómát vagy fehérjét kódoló géneit.

A szekvenálás olyan módszer, amely meghatározza a nukleotidok pontos sorrendjét egy adott DNS-molekulában. Ez csupán a négy alap helyes sorrendjét tükrözi; adenin (A), guanin (G), citozin (C) és timin (T) egy DNS-fragmensben. Számos szekvenálási módszer létezik, mint például a Sanger szekvenálás, a következő generációs szekvenálás, stb. Szintén szekvenálásra kerülhet akár egy szervezet teljes genomja (teljes genom szekvenálása), akár csak a genomban lévő fehérjét kódoló gének (exome szekvenálás)..

TARTALOMJEGYZÉK

1. Áttekintés és a legfontosabb különbség
2. Mi a teljes genom szekvenálása?
3. Mi az Exome szekvenálás?
4. hasonlóságok a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás között
5. Összegzés összehasonlítása - Teljes genom szekvenálás vs Exome szekvenálás táblázatos formában
6. Összegzés

Mi a teljes genom szekvenálása??

Az emberi genom csaknem három milliárd bázispár DNS-t tartalmaz. A teljes genom szekvenálása olyan módszer, amely a szervezet teljes genomját szekvenálja. Ezért a teljes genom szekvenálás során a DNS-molekulák teljes gyűjteményét vesszük figyelembe, beleértve exómokat, intronokat, intergenikus tereket stb. Ezen túlmenően, a teljes genom szekvenáló szekvenciák nemcsak a sejtmagban található genom, hanem a mitokondriális DNS is.

01. ábra: A teljes genom szekvenálása

A szekvenálás előkészítésekor az első lépés a teljes DNS extrahálása. Ezután az extrahált DNS-t megfelelő szekvenálási módszerrel szekvenálási eljárásnak vetjük alá. A kapott szekvenciák elemzésével, bioinformatikai eszköz felhasználásával megtudhatjuk a ritka betegségeket, rákot, fertőző betegségeket stb..

Mi az Exome szekvenálás??

Az exome a genom egy része, amely a genom körülbelül 1,5% -át tartalmazza, és az exonok gyűjteménye. Az exonok azok a szekvenciák, amelyek átírják az mRNS-t, majd a végső fehérjeterméket. Ennélfogva az exome szekvenáló szekvencia a genom teljes fehérjét kódoló szekvenciáit tartalmazza. Az exome szekvenálás feltárja a genetikai rendellenességeket, mivel a legtöbb genetikai rendellenesség a fehérjét kódoló gének mutációja miatt merül fel. Ezért a genetikai rendellenességek diagnosztikai folyamatai gyakran az exome szekvenálást használják módszerként a betegség diagnosztizálására. Továbbá, ha összehasonlítjuk a teljes genom szekvenálási alkalmazásával a genetikai teszteléshez, akkor az exome szekvenálás kevesebb időt vesz igénybe és olcsóbb..

02 ábra: Exome szekvenálás

Az exome szekvenálás során először csak a fehérjét kódoló szekvenciákat kell kiválasztani a teljes DNS-ből. Vegye figyelembe, hogy az embereknek körülbelül 180000 fehérjét kódoló szekvenciája van. Ezután az exome-t nagy teljesítményű szekvenálási módszerrel szekvenáljuk.

Milyen hasonlóságok vannak a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás között??

• A teljes genom szekvenálása és az Exome szekvenálása kétféle szekvenálás.
• Mindkét módszer hasznos a nukleotidszekvencia helyes sorrendjének meghatározásában mindkét módszernél.
• A bioinformatika mindkét módszernél segíti az adatok elemzését.

Mi a különbség a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás között??

A teljes genom szekvenáló szekvencia egy szervezet genomjának teljes DNS-ét szekvenálja, míg az exome szekvenáló szekvencia csak a genom fehérjét kódoló szekvenciáit tartalmazza. Ezért ez az alapvető különbség a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás között. Ugyanakkor, bár mindkét módszert széles körben alkalmazzák a nukleotid szekvencia helyes sorrendjének meghatározására, a teljes genom szekvenálás költséges és időigényes, mint az exome szekvenálás..

Az alábbi infographic táblázatok a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás közötti különbséget szemléltetik.

Összegzés - Teljes genom szekvenálás vs Exome szekvenálás

A szekvenálás megmutatja a bázisok pontos sorrendjét egy DNS-fragmentumban, és lehet akár teljes genom szekvenálás, akár exome szekvenálás. Itt a teljes genom szekvenáló szekvencia egy szervezet teljes genomját szekvenálja, míg az exome szekvenáló szekvencia csak a genom fehérjét kódoló szekvenciáit szekvenálja. Alkalmazásaikat figyelembe véve, a teljes genom szekvenálás segítséget nyújt a teljes genom genetikai rendellenességeinek, például egy nukleotid variációk, deléciók, inszerciók stb. Elemzésében, míg az exome szekvenálás segítséget nyújt a genetikai betegségek kimutatásában. Ezért ez a különbség a teljes genom szekvenálás és az exome szekvenálás között.

Referencia:

1. „Teljes genom vagy egész exome szekvenálás vs. célzott szekvenáló panelek.” Healio, SLACK Incorporated. Itt érhető el  
2. „Melyek a teljes exome szekvenálás és a teljes genom szekvenálás? - Genetikai otthoni referencia - NIH. ” Az Egyesült Államok Nemzeti Orvostudományi Könyvtára, Nemzeti Egészségügyi Intézetek. Itt érhető el  

Kép jóvoltából:

1. „Teljes genom lőfegyver-szekvenálás és hierarchikus pisztoly-szekvenálás”: Commins, J., Toft, C., Fares, M. A. - „Számítási biológiai módszerek és alkalmazásuk a rovarok endocelluláris szimbiotikus baktériumainak összehasonlító genomikájához.” (CC BY-SA 2.5) a Commons Wikimedia-on keresztül  
2. „Exome szekvenáló munkafolyamat 1a” SarahKusala - Saját munka, (CC BY 3.0) a Commons Wikimedia segítségével